More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1559 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  100 
 
 		 281 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  73.54 
 
 		 259 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  75.86 
 
 		 268 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  71.7 
 
 		 268 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  72.08 
 
 		 268 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  73.33 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  58.71 
 
 		 280 aa  289  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  59.93 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  56.99 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  58.53 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2062  RNA methyltransferase TrmH, group 3  56.52 
 
 		 283 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0229052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  60.68 
 
 		 273 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  63.25 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  60.26 
 
 		 273 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  46.98 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1254  RNA methyltransferase  51.38 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159804  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  50.99 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  52.42 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0360  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  49.64 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1336  RNA methyltransferase  48.39 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.57 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235223  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1314  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.15 
 
 		 296 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1412  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.15 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908439  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0968  RNA methyltransferase  47.95 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0219055 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0558  RNA methyltransferase  49.34 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162254  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  47.66 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2426  RNA methyltransferase  45.93 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  44.69 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2255  RNA methyltransferase  46.19 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0110995  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  46.15 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2049  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.42 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.86 
 
 		 348 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1364  RNA methyltransferase TrmH, group 3  45.98 
 
 		 271 aa  165  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84942  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2239  tRNA/rRNA metyltransferase  44.07 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0914  RNA methyltransferase  44.07 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1606  RNA methyltransferase  40.74 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15011  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2801  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.8 
 
 		 260 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3826  RNA methyltransferase  47.16 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2757  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.75 
 
 		 321 aa  156  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.611419 
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  37.08 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0846  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.62 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139402  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.91 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.91 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1817  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.19 
 
 		 289 aa  145  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.503004 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35 
 
 		 416 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.6 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35 
 
 		 442 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06961  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.02 
 
 		 413 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.1089  normal  0.124675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3414  RNA methyltransferase  39.04 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.377337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  36.75 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.24 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  38.11 
 
 		 323 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  31.91 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.24 
 
 		 349 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  35.97 
 
 		 323 aa  135  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  33.06 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.08 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  37.74 
 
 		 536 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.67 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.93 
 
 		 254 aa  135  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  36.25 
 
 		 242 aa  135  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.55 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.39 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.27 
 
 		 542 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.39 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.75 
 
 		 248 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.14 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.84 
 
 		 261 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  44.89 
 
 		 244 aa  132  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  36.55 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.1 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  41.6 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  36.97 
 
 		 249 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3018  RNA methyltransferase  37.15 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.4 
 
 		 387 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.78 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  37.39 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  37.39 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.68 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.13 
 
 		 334 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1469  RNA methyltransferase  36.55 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  36.97 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1817  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  44 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1448  RNA methyltransferase  36.55 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.13 
 
 		 247 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  36.13 
 
 		 247 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  36.97 
 
 		 247 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  36.97 
 
 		 247 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  36.97 
 
 		 247 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  36.97 
 
 		 247 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.82 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4246  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.92 
 
 		 363 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  36.97 
 
 		 247 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  36.97 
 
 		 247 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  35.42 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  42.22 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  41.67 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.39 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.39 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>