More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0208 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  100 
 
 		 269 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  97.37 
 
 		 268 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  98.12 
 
 		 268 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  76.17 
 
 		 259 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  74.67 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  74.7 
 
 		 281 aa  316  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  60.31 
 
 		 275 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  58.4 
 
 		 283 aa  280  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  59.11 
 
 		 273 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2062  RNA methyltransferase TrmH, group 3  60.16 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0229052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  58.47 
 
 		 273 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  59.06 
 
 		 280 aa  275  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  58.27 
 
 		 275 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  63.25 
 
 		 288 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  52.31 
 
 		 286 aa  231  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1254  RNA methyltransferase  51.72 
 
 		 286 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159804  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  51.34 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  53.28 
 
 		 293 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1314  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50.81 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.2 
 
 		 276 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235223  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1412  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  52.73 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908439  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0558  RNA methyltransferase  47.24 
 
 		 276 aa  209  6e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162254  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0360  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  48.85 
 
 		 293 aa  206  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1336  RNA methyltransferase  46.84 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0968  RNA methyltransferase  47.62 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0219055 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  46.21 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  47.06 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  46.18 
 
 		 348 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2049  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.88 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2255  RNA methyltransferase  43.55 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0110995  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2239  tRNA/rRNA metyltransferase  43.37 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0914  RNA methyltransferase  43.37 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  46.64 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2801  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.84 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1364  RNA methyltransferase TrmH, group 3  45.54 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84942  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2757  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  48.92 
 
 		 321 aa  156  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.611419 
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  35.83 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3826  RNA methyltransferase  45.11 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2426  RNA methyltransferase  45.04 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1606  RNA methyltransferase  38.66 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15011  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1817  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.85 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.503004 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  32.37 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0846  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.4 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139402  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  35.27 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.07 
 
 		 336 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.16 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.91 
 
 		 416 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3018  RNA methyltransferase  38.96 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.91 
 
 		 442 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.02 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2268  RNA methyltransferase  39.02 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144304  normal  0.908224 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06961  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.41 
 
 		 413 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.1089  normal  0.124675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.13 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.48 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.86 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  33.95 
 
 		 323 aa  125  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.2 
 
 		 234 aa  125  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  38.46 
 
 		 248 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3414  RNA methyltransferase  39.02 
 
 		 248 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.377337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.93 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1817  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  39.02 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.47 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.44 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0411  RNA methyltransferase  35 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  32.38 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  38.03 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  39.45 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.73 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  38.04 
 
 		 536 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.18 
 
 		 246 aa  122  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.25 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.8 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4032  RNA methyltransferase  37.9 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104893  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  36.21 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.59 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.56 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  33.47 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0147  RNA methyltransferase  41.85 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.22 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1937  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.63 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.177305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.29 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.48 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  36.65 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1952  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.55 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  34.85 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.48 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1890  RNA methyltransferase  35.48 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.575059 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  36.65 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  36.65 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  36.65 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  36.65 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  37.94 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3029  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.25 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.068461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  36.65 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  36.65 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.13 
 
 		 250 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.45 
 
 		 334 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.92 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>