More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0404 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  83.33 
 
 		 252 aa  440  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  54.55 
 
 		 254 aa  281  5.000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.47 
 
 		 348 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  37.14 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  34.44 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2757  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.71 
 
 		 321 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.611419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.02 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.89 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.89 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2062  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.17 
 
 		 283 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0229052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.02 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.54 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.6 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  32.65 
 
 		 243 aa  151  8.999999999999999e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0558  RNA methyltransferase  35.1 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162254  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.33 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  34.87 
 
 		 293 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.92 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.6 
 
 		 276 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235223  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.92 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2801  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.47 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  32.5 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1295  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.68 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.96 
 
 		 310 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  31.8 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  31.12 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1314  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.78 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1412  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.78 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908439  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.37 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  32.93 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.4 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  30.99 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  30.08 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.68 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.36 
 
 		 292 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.36 
 
 		 292 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.05 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2426  RNA methyltransferase  29.65 
 
 		 247 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  36.75 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0360  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.74 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.12 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.75 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  33.19 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  34.15 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1817  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.47 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.503004 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  30.08 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0869  RNA methyltransferase  29.32 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0526  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.14 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2255  RNA methyltransferase  30.77 
 
 		 261 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0110995  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 286 aa  138  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.74 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.67 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.37 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.96 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  30.17 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.34 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  32.2 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  29.75 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.43 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  28.74 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0988  tRNA/rRNA methyltransferase  28.92 
 
 		 249 aa  136  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1336  RNA methyltransferase  33.75 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.58 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1469  RNA methyltransferase  29.96 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  29.96 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1448  RNA methyltransferase  29.96 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  31.71 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30.17 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.93 
 
 		 250 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1254  RNA methyltransferase  32.64 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159804  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  29.34 
 
 		 250 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0968  RNA methyltransferase  32.17 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0219055 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.63 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2239  tRNA/rRNA metyltransferase  31.49 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.17 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.55 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0914  RNA methyltransferase  31.49 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106416 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  29.55 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  28.51 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  29.55 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0060  RNA methyltransferase  34.55 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.024169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  32.78 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2049  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.89 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.75 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.25 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.39 
 
 		 248 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.23 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  29.15 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  30.17 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  30.74 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  30.74 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  28.74 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  28.74 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  28.74 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  28.74 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  28.74 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  28.74 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>