More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1254 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1254  RNA methyltransferase  100 
 
 
286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159804  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  99.65 
 
 
303 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  93.71 
 
 
286 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  65.83 
 
 
293 aa  360  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  64.66 
 
 
276 aa  351  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235223  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0968  RNA methyltransferase  62.02 
 
 
291 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0219055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1314  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  64.64 
 
 
296 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1412  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  64.53 
 
 
296 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908439  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0558  RNA methyltransferase  58.76 
 
 
276 aa  317  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162254  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  56.77 
 
 
275 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  56.77 
 
 
275 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  52.55 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  51.84 
 
 
283 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  52.8 
 
 
273 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2062  RNA methyltransferase TrmH, group 3  49.64 
 
 
283 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0229052  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  54.43 
 
 
288 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  52.4 
 
 
273 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.74 
 
 
268 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.32 
 
 
259 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  50.38 
 
 
268 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50.77 
 
 
268 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  51.5 
 
 
281 aa  205  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  54.11 
 
 
269 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  46.86 
 
 
288 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  48.32 
 
 
263 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2049  RNA methyltransferase TrmH, group 3  48.51 
 
 
262 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1336  RNA methyltransferase  44.19 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0360  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.57 
 
 
293 aa  188  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3826  RNA methyltransferase  49.36 
 
 
265 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2239  tRNA/rRNA metyltransferase  46.37 
 
 
261 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0914  RNA methyltransferase  46.37 
 
 
261 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106416 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  46.85 
 
 
276 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2255  RNA methyltransferase  46.59 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0110995  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2426  RNA methyltransferase  42.74 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2801  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.44 
 
 
260 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2757  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  48.03 
 
 
321 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.611419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1364  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.96 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84942  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0846  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.97 
 
 
272 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139402  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.66 
 
 
348 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1606  RNA methyltransferase  42.24 
 
 
278 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15011  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  34.62 
 
 
254 aa  143  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  37.77 
 
 
243 aa  143  4e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1817  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.5 
 
 
289 aa  142  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.503004 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  32.64 
 
 
252 aa  135  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  32.23 
 
 
252 aa  132  6e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.86 
 
 
246 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.8 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  36.55 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.8 
 
 
251 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  36.55 
 
 
254 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.55 
 
 
247 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  36.55 
 
 
249 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  35.51 
 
 
248 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0152  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.04 
 
 
245 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3414  RNA methyltransferase  42.93 
 
 
248 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.377337  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  35.83 
 
 
248 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.57 
 
 
250 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.6 
 
 
336 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  35.83 
 
 
248 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.55 
 
 
250 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.87 
 
 
246 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  36.4 
 
 
270 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  38.21 
 
 
248 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  36.75 
 
 
242 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.45 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  37.76 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.4 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  37.65 
 
 
248 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1817  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  44.25 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392601  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  35.98 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.76 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  34.39 
 
 
248 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.18 
 
 
349 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.02 
 
 
250 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  43.93 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.83 
 
 
251 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1937  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.81 
 
 
251 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.177305  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3601  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.02 
 
 
243 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.66 
 
 
248 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.4 
 
 
246 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3444  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.02 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.882432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3288  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.02 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679975  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.34 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.69 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  41.9 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0439  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.51 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000546108 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0789  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.6 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4766  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.73 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  35.29 
 
 
245 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1625  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.92 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.117052  hitchhiker  0.00235214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  38.33 
 
 
536 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.82 
 
 
246 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4032  RNA methyltransferase  38.17 
 
 
263 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104893  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4637  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.31 
 
 
243 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4787  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.31 
 
 
243 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.535347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0887  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.71 
 
 
261 aa  115  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4730  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.31 
 
 
243 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653349  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.7 
 
 
248 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0363  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.31 
 
 
244 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4424  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.89 
 
 
243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>