More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1084 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
276 aa  548  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  66.2 
 
 
286 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1254  RNA methyltransferase  64.66 
 
 
286 aa  351  5.9999999999999994e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159804  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  64.66 
 
 
303 aa  351  8e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0968  RNA methyltransferase  60.84 
 
 
291 aa  311  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0219055 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  57.93 
 
 
293 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1314  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  58.3 
 
 
296 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1412  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  58.16 
 
 
296 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908439  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0558  RNA methyltransferase  56.51 
 
 
276 aa  285  4e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  57.68 
 
 
275 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  57.72 
 
 
288 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2062  RNA methyltransferase TrmH, group 3  56.05 
 
 
283 aa  245  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0229052  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  58.87 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  59.13 
 
 
283 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  57.2 
 
 
275 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  58.44 
 
 
273 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  54.62 
 
 
280 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.19 
 
 
259 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.84 
 
 
268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  50.6 
 
 
268 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.95 
 
 
269 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50.2 
 
 
268 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  52.52 
 
 
288 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  48.35 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1336  RNA methyltransferase  45.91 
 
 
293 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  45.32 
 
 
276 aa  188  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  47.48 
 
 
263 aa  185  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0360  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  48.88 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2049  RNA methyltransferase TrmH, group 3  45.57 
 
 
262 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2255  RNA methyltransferase  46.06 
 
 
261 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0110995  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2239  tRNA/rRNA metyltransferase  45.02 
 
 
261 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0914  RNA methyltransferase  45.02 
 
 
261 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106416 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3826  RNA methyltransferase  45.02 
 
 
265 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2801  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.04 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1364  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.96 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84942  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2757  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.88 
 
 
321 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.611419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2426  RNA methyltransferase  40.73 
 
 
247 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0846  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.4 
 
 
272 aa  155  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139402  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.42 
 
 
348 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1606  RNA methyltransferase  39.42 
 
 
278 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15011  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  39.41 
 
 
243 aa  152  5e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  36.17 
 
 
252 aa  149  6e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  34.6 
 
 
252 aa  148  7e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  35.04 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1817  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.71 
 
 
289 aa  142  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.503004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.98 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.62 
 
 
232 aa  126  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.21 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  43.46 
 
 
246 aa  125  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  34.98 
 
 
248 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1625  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.1 
 
 
251 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.117052  hitchhiker  0.00235214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  34.98 
 
 
248 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  34.98 
 
 
248 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  36.48 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  35.68 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.43 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  34.29 
 
 
248 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  35.27 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.63 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.15 
 
 
246 aa  118  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  34.66 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.21 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1937  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.33 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.177305  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.47 
 
 
255 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.66 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.08 
 
 
247 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3414  RNA methyltransferase  40.11 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.377337  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.97 
 
 
234 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.44 
 
 
246 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  34.05 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.14 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1817  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  35.59 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392601  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.14 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.9 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.77 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.07 
 
 
261 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  42.13 
 
 
251 aa  113  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  34.71 
 
 
248 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  39.31 
 
 
247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.34 
 
 
336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.11 
 
 
246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  33.61 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  35.92 
 
 
536 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  34.32 
 
 
244 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.82 
 
 
247 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  33.61 
 
 
270 aa  112  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.34 
 
 
416 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.73 
 
 
247 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  29.93 
 
 
289 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  32.92 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.88 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  29.93 
 
 
289 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.29 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  33.2 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  39.2 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3288  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.43 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679975  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06961  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.69 
 
 
413 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.1089  normal  0.124675 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.34 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.66 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.03 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>