More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1314 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1314  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  100 
 
 
296 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1412  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  95.61 
 
 
296 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908439  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  80 
 
 
293 aa  464  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0968  RNA methyltransferase  77.1 
 
 
291 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0219055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  65.84 
 
 
286 aa  355  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1254  RNA methyltransferase  64.64 
 
 
286 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159804  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  63.01 
 
 
303 aa  349  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.78 
 
 
276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235223  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0558  RNA methyltransferase  56.47 
 
 
276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  58.14 
 
 
273 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  57.59 
 
 
273 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  56.25 
 
 
280 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  60.68 
 
 
275 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  60.34 
 
 
283 aa  251  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2062  RNA methyltransferase TrmH, group 3  54.78 
 
 
283 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0229052  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.23 
 
 
259 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  57.02 
 
 
288 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.02 
 
 
268 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  56.45 
 
 
275 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  54.82 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  53.95 
 
 
268 aa  219  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  54.39 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  52.44 
 
 
281 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  51.06 
 
 
288 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2049  RNA methyltransferase TrmH, group 3  48.51 
 
 
262 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1336  RNA methyltransferase  48.47 
 
 
293 aa  205  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0360  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  49.31 
 
 
293 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2255  RNA methyltransferase  49.78 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0110995  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2239  tRNA/rRNA metyltransferase  48.28 
 
 
261 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0914  RNA methyltransferase  48.28 
 
 
261 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106416 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3826  RNA methyltransferase  50.87 
 
 
265 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  47.9 
 
 
263 aa  192  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2801  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.58 
 
 
260 aa  189  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  46.61 
 
 
276 aa  185  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2757  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  48.7 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.611419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2426  RNA methyltransferase  43.44 
 
 
247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1364  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.41 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84942  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  38.11 
 
 
254 aa  171  1e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.11 
 
 
348 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0846  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.67 
 
 
272 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139402  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  35.68 
 
 
252 aa  157  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1606  RNA methyltransferase  42.86 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15011  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1817  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.31 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.503004 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  34.85 
 
 
252 aa  151  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  36.4 
 
 
243 aa  142  5e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  39.08 
 
 
249 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  38.66 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  40 
 
 
245 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  36.21 
 
 
254 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.69 
 
 
251 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1937  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.48 
 
 
251 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.177305  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1817  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  46.2 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392601  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3414  RNA methyltransferase  46.29 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.377337  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0439  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.24 
 
 
243 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000546108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  38.14 
 
 
250 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.34 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.4 
 
 
250 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.18 
 
 
246 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  36.75 
 
 
270 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.4 
 
 
250 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  36.32 
 
 
270 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.3 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  38.91 
 
 
246 aa  129  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.44 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  38.3 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  38.46 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0887  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.13 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0147  RNA methyltransferase  35.06 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  39.15 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.24 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.11 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  43.86 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.75 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  35.56 
 
 
248 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  35.56 
 
 
248 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0352  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.43 
 
 
268 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.426039  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  44.26 
 
 
244 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  35.56 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.49 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  37.61 
 
 
247 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3601  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.89 
 
 
243 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3029  RNA methyltransferase TrmH, group 3  48.61 
 
 
264 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.068461  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.4 
 
 
246 aa  125  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.47 
 
 
349 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.69 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.53 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  42.69 
 
 
247 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.69 
 
 
247 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0152  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.97 
 
 
245 aa  125  9e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4647  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.55 
 
 
243 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4637  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.55 
 
 
243 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4730  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.55 
 
 
243 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653349  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1625  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.39 
 
 
251 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.117052  hitchhiker  0.00235214 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3018  RNA methyltransferase  48.63 
 
 
250 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4787  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.55 
 
 
243 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.535347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.67 
 
 
251 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3644  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.75 
 
 
246 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  43.27 
 
 
247 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3790  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.75 
 
 
246 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  43.27 
 
 
247 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>