More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2062 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2062  RNA methyltransferase TrmH, group 3  100 
 
 		 283 aa  563  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0229052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  86.52 
 
 		 283 aa  481  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  75.18 
 
 		 280 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  75.97 
 
 		 275 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  77.3 
 
 		 273 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  76.24 
 
 		 273 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  75.97 
 
 		 275 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  67.84 
 
 		 288 aa  300  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.45 
 
 		 268 aa  271  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.14 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  61.51 
 
 		 268 aa  258  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  61.51 
 
 		 268 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  63.39 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  60.25 
 
 		 281 aa  255  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  51.38 
 
 		 293 aa  251  9.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.05 
 
 		 276 aa  245  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235223  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1254  RNA methyltransferase  49.64 
 
 		 286 aa  241  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1314  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  54.47 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  49.28 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  49.46 
 
 		 286 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1412  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  54.09 
 
 		 296 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908439  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0968  RNA methyltransferase  57.8 
 
 		 291 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0219055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0360  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  57.53 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0558  RNA methyltransferase  54.26 
 
 		 276 aa  234  9e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1336  RNA methyltransferase  50.75 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  48.18 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  50.43 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2757  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  52.44 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.611419 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.36 
 
 		 348 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2255  RNA methyltransferase  44.68 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0110995  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2801  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.29 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2426  RNA methyltransferase  43.72 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2049  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.79 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2239  tRNA/rRNA metyltransferase  43.75 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695793  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1364  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.14 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84942  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  44.64 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0914  RNA methyltransferase  43.3 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106416 
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  36.32 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1606  RNA methyltransferase  39.85 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15011  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  35.17 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3826  RNA methyltransferase  44.35 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1937  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.48 
 
 		 251 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.177305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1817  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.16 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.503004 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  40.25 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  39.83 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  33.91 
 
 		 252 aa  145  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  35.19 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0846  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.22 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139402  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.42 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.82 
 
 		 247 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  38.03 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.91 
 
 		 246 aa  132  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.19 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0219  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.29 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0152  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.43 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  33.75 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.68 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  37.61 
 
 		 248 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.15 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  37.61 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.21 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.97 
 
 		 246 aa  129  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.32 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.75 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.97 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  36.48 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1625  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.47 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.117052  hitchhiker  0.00235214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.78 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  35.78 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.78 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0738  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.47 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000750261  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  36.21 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1469  RNA methyltransferase  35.78 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1448  RNA methyltransferase  35.78 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0708  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.47 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.106779  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3646  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.47 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.15 
 
 		 247 aa  126  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  35.78 
 
 		 247 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.69 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  35.17 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.78 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0750  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.47 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  35.17 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  35.34 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.6 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  35.34 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  35.34 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  35.34 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.34 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  35.34 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  35.34 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  35.27 
 
 		 323 aa  125  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  35.34 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1105  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.65 
 
 		 255 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.919918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0991  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase, putative  35.65 
 
 		 255 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3354  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.05 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0824924  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  34.48 
 
 		 250 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.79 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  34.48 
 
 		 248 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0289755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>