More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1606 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1606  RNA methyltransferase  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15011  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  48.28 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.69 
 
 		 348 aa  185  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.19 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.16 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2426  RNA methyltransferase  44.09 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.91 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.11 
 
 		 283 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  46.54 
 
 		 276 aa  168  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0360  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.05 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.6 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.29 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1336  RNA methyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2062  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.85 
 
 		 283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0229052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.42 
 
 		 276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235223  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1817  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.62 
 
 		 289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.503004 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  42.24 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2239  tRNA/rRNA metyltransferase  44.2 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695793  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.97 
 
 		 335 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0846  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.41 
 
 		 272 aa  160  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139402  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0914  RNA methyltransferase  44.2 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  41.74 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1254  RNA methyltransferase  42.24 
 
 		 286 aa  158  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159804  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.87 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  42.24 
 
 		 303 aa  158  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.54 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.34 
 
 		 349 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.96 
 
 		 442 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.91 
 
 		 416 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  39.19 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  41.13 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  43.03 
 
 		 536 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.97 
 
 		 336 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1364  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.09 
 
 		 271 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84942  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.55 
 
 		 652 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.32 
 
 		 542 aa  152  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2757  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.41 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.611419 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0558  RNA methyltransferase  38.98 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  40 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1314  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.7 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  39.31 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  37.45 
 
 		 243 aa  149  7e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2255  RNA methyltransferase  41.07 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0110995  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.93 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1412  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.73 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908439  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3826  RNA methyltransferase  42.98 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  43.93 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06961  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.34 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.1089  normal  0.124675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  38.52 
 
 		 250 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.41 
 
 		 269 aa  141  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0968  RNA methyltransferase  38.58 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0219055 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2049  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.3 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  35.48 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.15 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.09 
 
 		 316 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2801  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.87 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  38.57 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  38.26 
 
 		 323 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.57 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.57 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  43.82 
 
 		 314 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.57 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  36.18 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  31.52 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.49 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  45.99 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  32.22 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0439  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.85 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000546108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  36.03 
 
 		 245 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  41.74 
 
 		 320 aa  132  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.33 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  42.7 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0988  tRNA/rRNA methyltransferase  38.06 
 
 		 249 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  38.65 
 
 		 255 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.6 
 
 		 246 aa  132  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0768  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.03 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1473  rRNA methylase  34.93 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  38.37 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  39.02 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2119  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.13 
 
 		 519 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383182 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  42.61 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.89 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.29 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  46.89 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0869  RNA methyltransferase  38.06 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  37.66 
 
 		 248 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.51 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  41 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.08 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  36.82 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  45.2 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  40.34 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.78 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0789  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.1 
 
 		 244 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  39.29 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.92 
 
 		 247 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.45 
 
 		 234 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  36.55 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  37.39 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  36.97 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>