More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2757 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2757  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  100 
 
 
321 aa  628  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.611419 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  63.68 
 
 
276 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  48.15 
 
 
288 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2062  RNA methyltransferase TrmH, group 3  49.81 
 
 
283 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0229052  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  50.4 
 
 
283 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  44.52 
 
 
303 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1254  RNA methyltransferase  44.52 
 
 
286 aa  198  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  44.33 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  46.97 
 
 
348 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  50.41 
 
 
273 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  49.59 
 
 
273 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  50 
 
 
280 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  49.8 
 
 
275 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  49.78 
 
 
275 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0968  RNA methyltransferase  46.5 
 
 
291 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0219055 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  44 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2426  RNA methyltransferase  45.45 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.64 
 
 
268 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  49.78 
 
 
288 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.52 
 
 
276 aa  182  9.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235223  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1314  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.91 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1412  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.53 
 
 
296 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908439  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0558  RNA methyltransferase  44.44 
 
 
276 aa  176  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162254  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  35.97 
 
 
254 aa  175  8e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  34.69 
 
 
252 aa  175  9.999999999999999e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1336  RNA methyltransferase  42.52 
 
 
293 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.43 
 
 
268 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  33.88 
 
 
252 aa  170  3e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  45.82 
 
 
268 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.41 
 
 
269 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.06 
 
 
259 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0360  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.71 
 
 
293 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0846  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.31 
 
 
272 aa  165  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139402  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  40.5 
 
 
249 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  38.56 
 
 
243 aa  163  4.0000000000000004e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1364  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.69 
 
 
271 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84942  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1606  RNA methyltransferase  41.52 
 
 
278 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15011  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  40.08 
 
 
249 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  46.38 
 
 
281 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  46.19 
 
 
263 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2801  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.75 
 
 
260 aa  155  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2239  tRNA/rRNA metyltransferase  44.1 
 
 
261 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0914  RNA methyltransferase  44.1 
 
 
261 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2255  RNA methyltransferase  44.05 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0110995  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3826  RNA methyltransferase  44.59 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0352  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.37 
 
 
268 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.426039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.34 
 
 
315 aa  139  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2049  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.2 
 
 
262 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40 
 
 
246 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  40.08 
 
 
248 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.98 
 
 
248 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  40.42 
 
 
245 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0152  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  41.32 
 
 
245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4637  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.16 
 
 
243 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4647  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.16 
 
 
243 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4730  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.16 
 
 
243 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653349  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4787  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.16 
 
 
243 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.535347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  40.16 
 
 
248 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  38.8 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.33 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  42.22 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4766  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.51 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  47.37 
 
 
254 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  38.55 
 
 
248 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  39.75 
 
 
248 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1817  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  46.32 
 
 
247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392601  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  38.87 
 
 
248 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0988  tRNA/rRNA methyltransferase  36.8 
 
 
249 aa  133  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  39.92 
 
 
250 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0439  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.59 
 
 
243 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000546108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.13 
 
 
237 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04047  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  38.34 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.34 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4424  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.34 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5696  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.34 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4740  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.34 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3833  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.34 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000869352 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04009  hypothetical protein  38.34 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4651  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.34 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.326823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0363  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.34 
 
 
244 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  36.65 
 
 
255 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0869  RNA methyltransferase  36.8 
 
 
249 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  39.77 
 
 
536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1890  RNA methyltransferase  44.62 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.575059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  42.32 
 
 
249 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  45.19 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.8 
 
 
246 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.1 
 
 
349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.25 
 
 
336 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  43.26 
 
 
323 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.97 
 
 
256 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0768  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.59 
 
 
244 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  34.85 
 
 
258 aa  130  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.97 
 
 
256 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4711  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  48.65 
 
 
243 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.43 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.8 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0789  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.59 
 
 
244 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.98 
 
 
256 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3644  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  51.68 
 
 
246 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>