More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1939 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  100 
 
 
286 aa  573  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1254  RNA methyltransferase  93.71 
 
 
286 aa  543  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159804  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  93.36 
 
 
303 aa  542  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.2 
 
 
276 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235223  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  64.75 
 
 
293 aa  361  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0968  RNA methyltransferase  62.72 
 
 
291 aa  345  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0219055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1314  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  65.84 
 
 
296 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1412  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  65.12 
 
 
296 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908439  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0558  RNA methyltransferase  59.85 
 
 
276 aa  324  1e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162254  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  52.57 
 
 
283 aa  248  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  56.33 
 
 
275 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  55.9 
 
 
275 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  54.29 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  54.07 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  55.02 
 
 
273 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2062  RNA methyltransferase TrmH, group 3  49.46 
 
 
283 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0229052  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.17 
 
 
268 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.07 
 
 
259 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  54.15 
 
 
273 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  50.97 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.35 
 
 
268 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  54.78 
 
 
269 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  51.5 
 
 
281 aa  208  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  46.13 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  48.32 
 
 
263 aa  195  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2049  RNA methyltransferase TrmH, group 3  48.51 
 
 
262 aa  192  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1336  RNA methyltransferase  44.79 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0360  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.92 
 
 
293 aa  189  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3826  RNA methyltransferase  48.93 
 
 
265 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  46.4 
 
 
276 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2239  tRNA/rRNA metyltransferase  47.58 
 
 
261 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0914  RNA methyltransferase  47.58 
 
 
261 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2255  RNA methyltransferase  48.68 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0110995  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2426  RNA methyltransferase  42.32 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2801  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.07 
 
 
260 aa  178  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2757  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  48.25 
 
 
321 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.611419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1364  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.56 
 
 
271 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84942  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0846  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.97 
 
 
272 aa  165  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139402  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1606  RNA methyltransferase  42.24 
 
 
278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15011  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.83 
 
 
348 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  34.02 
 
 
254 aa  145  6e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  37.77 
 
 
243 aa  143  4e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1817  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.14 
 
 
289 aa  143  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.503004 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  33.05 
 
 
252 aa  138  1e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.71 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  31.54 
 
 
252 aa  135  8e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.21 
 
 
250 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  36.48 
 
 
248 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  38.24 
 
 
249 aa  133  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0152  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.09 
 
 
245 aa  132  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  38.24 
 
 
249 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.68 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  36.07 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  36.4 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  46.82 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.75 
 
 
255 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  33.46 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.02 
 
 
247 aa  129  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.75 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  38.21 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.33 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0363  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.98 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.51 
 
 
250 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4637  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.86 
 
 
243 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4787  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.86 
 
 
243 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.535347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0439  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.93 
 
 
243 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000546108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3414  RNA methyltransferase  42.93 
 
 
248 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.377337  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4730  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.86 
 
 
243 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653349  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04047  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  35.44 
 
 
243 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.44 
 
 
243 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4647  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.86 
 
 
243 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4740  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.44 
 
 
243 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04009  hypothetical protein  35.44 
 
 
243 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4424  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.44 
 
 
243 aa  125  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3833  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.44 
 
 
243 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000869352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4651  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.44 
 
 
243 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.326823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5696  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.44 
 
 
243 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  44.13 
 
 
247 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  35.17 
 
 
254 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4766  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.44 
 
 
243 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.24 
 
 
246 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  38.14 
 
 
248 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  37.96 
 
 
248 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  36.11 
 
 
270 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.17 
 
 
251 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3601  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.44 
 
 
243 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0789  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.44 
 
 
244 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4711  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.56 
 
 
243 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  42.71 
 
 
246 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  43.82 
 
 
247 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.68 
 
 
247 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  36.48 
 
 
242 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.68 
 
 
247 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.56 
 
 
234 aa  123  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3444  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.44 
 
 
243 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.882432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  36.02 
 
 
244 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0887  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.1 
 
 
261 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  35.71 
 
 
270 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1937  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.78 
 
 
251 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.177305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>