More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3902 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 109 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  71.57 
 
 		 111 aa  150  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  67.89 
 
 		 109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  73.2 
 
 		 111 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4551  regulatory protein ArsR  66.36 
 
 		 110 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5082  transcriptional regulator, ArsR family  71.43 
 
 		 107 aa  135  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3317  transcriptional regulator, TrmB  58.33 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  67.02 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2599  ArsR family transcriptional regulator  67.71 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4416  ArsR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.381445  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4189  ArsR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519791  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4255  ArsR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  67.37 
 
 		 168 aa  126  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4237  ArsR family transcriptional regulator  63 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0889801  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2439  ArsR family transcriptional regulator  67.31 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561619  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  60.19 
 
 		 111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  58.65 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2717  ArsR family transcriptional regulator  56.31 
 
 		 111 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  60.67 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  58.16 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  59.6 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  62.22 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  56.52 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  60.82 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  55.43 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  42.55 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  48.39 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  39.47 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  44 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  41.43 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  41.43 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  39.77 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  42.03 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  42.03 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  42.03 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2507  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 245 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3931  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 241 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.280482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3818  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 241 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4445  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  38 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  29.76 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2949  regulatory protein, ArsR  31.03 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 228 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  38.03 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1990  regulatory protein ArsR  35.87 
 
 		 229 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.126162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  42.65 
 
 		 103 aa  48.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03940  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.621476  normal  0.0987714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 		 106 aa  47.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  31.46 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3471  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 253 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114608  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  44.62 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0701  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 228 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5180  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 227 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>