80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2193 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 177 aa  360  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  100 
 
 		 177 aa  360  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  86.44 
 
 		 177 aa  313  8e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  42.66 
 
 		 208 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  43.45 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  44.7 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  46.21 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  46.21 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  45.86 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  44.36 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  39.39 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  39.55 
 
 		 212 aa  95.9  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  36.92 
 
 		 242 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  38.46 
 
 		 243 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  35.66 
 
 		 241 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  34.65 
 
 		 242 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 358 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  37.4 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  34.06 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  34.42 
 
 		 220 aa  85.5  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  35.07 
 
 		 534 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  30.52 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  34.64 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  36.22 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  36.22 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  31.5 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  34.59 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  34.35 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  36.72 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  35.94 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  33.77 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  32.88 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  30.97 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  32.68 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  28.29 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  33.12 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  33.54 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  31.82 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  31.48 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  30.99 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  34.38 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  32.32 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  32.03 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  25.64 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  25 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  27.1 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4029  hypothetical protein  31.15 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  28.21 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  30.94 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  24.68 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  30.72 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  34.96 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  27.66 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  29.55 
 
 		 250 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  30.27 
 
 		 263 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  28.95 
 
 		 175 aa  51.6  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0791  hypothetical protein  32.1 
 
 		 319 aa  51.2  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0742  putative lipoprotein  32.1 
 
 		 319 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  32.37 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  31.06 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  26.85 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  32.2 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6410  succinoglycan biosynthesis protein ExoI-like protein  33.58 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  27.95 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  30.14 
 
 		 246 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0217  hypothetical protein  28.72 
 
 		 236 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  22.49 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  25.44 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  27.18 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4567  succinoglycan biosynthesis protein ExoI-like protein  33.08 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019847  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  27.54 
 
 		 231 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  34.04 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  27.97 
 
 		 246 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4113  hypothetical protein  31.4 
 
 		 423 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  27.39 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1670  hypothetical protein  29.75 
 
 		 430 aa  41.2  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299768  normal  0.863632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1653  hypothetical protein  22.08 
 
 		 170 aa  41.2  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1848  hypothetical protein  27.78 
 
 		 436 aa  41.2  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1569  hypothetical protein  27.78 
 
 		 436 aa  41.2  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  0.0673531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  32.23 
 
 		 153 aa  41.2  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>