More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0537 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  100 
 
 		 287 aa  579  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  59.75 
 
 		 681 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  57.95 
 
 		 699 aa  205  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  57.39 
 
 		 697 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  57.39 
 
 		 697 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  59.12 
 
 		 676 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  54.49 
 
 		 674 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  56.76 
 
 		 683 aa  178  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  56.21 
 
 		 692 aa  175  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  50.27 
 
 		 690 aa  175  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  57.55 
 
 		 676 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  47.09 
 
 		 681 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  56.83 
 
 		 680 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  57.78 
 
 		 695 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  49.11 
 
 		 665 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  56.83 
 
 		 695 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  52.29 
 
 		 687 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  50.62 
 
 		 646 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  57.97 
 
 		 615 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  57.25 
 
 		 621 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  48.57 
 
 		 656 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  50.62 
 
 		 651 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  50.62 
 
 		 651 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  47.4 
 
 		 640 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  49.38 
 
 		 651 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  46.82 
 
 		 640 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  55.07 
 
 		 645 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  47.34 
 
 		 648 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  51.8 
 
 		 646 aa  151  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  44.51 
 
 		 569 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  47.37 
 
 		 577 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  47.4 
 
 		 533 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  46.62 
 
 		 577 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  46.72 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  44.2 
 
 		 465 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  46.1 
 
 		 471 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  46.1 
 
 		 471 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  45.11 
 
 		 581 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  42.2 
 
 		 475 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  41.62 
 
 		 474 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  42.2 
 
 		 503 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  46.38 
 
 		 517 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  42.68 
 
 		 468 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  42.2 
 
 		 473 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  49.62 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  42.2 
 
 		 475 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  42.2 
 
 		 473 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  44.08 
 
 		 464 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  42.77 
 
 		 475 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  47.48 
 
 		 490 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  42.68 
 
 		 447 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  50 
 
 		 524 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  41.62 
 
 		 472 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  45.27 
 
 		 446 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  49.62 
 
 		 527 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  50.43 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  44.09 
 
 		 419 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  45 
 
 		 480 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  42.18 
 
 		 402 aa  126  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  39.39 
 
 		 479 aa  125  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  46.67 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  48.91 
 
 		 513 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  47.15 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  47.15 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  42.68 
 
 		 462 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  43.45 
 
 		 472 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  45.59 
 
 		 465 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  43.54 
 
 		 523 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  45.39 
 
 		 490 aa  122  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  50 
 
 		 441 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  44.12 
 
 		 385 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  42.75 
 
 		 429 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  50 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  50 
 
 		 431 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  38.07 
 
 		 513 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  53.64 
 
 		 379 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  46.09 
 
 		 459 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  47.26 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  42.55 
 
 		 490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  42.65 
 
 		 460 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  38.98 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  45.86 
 
 		 386 aa  119  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  44.12 
 
 		 455 aa  119  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.17 
 
 		 441 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  46.92 
 
 		 430 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  49.59 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  38.98 
 
 		 386 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  46.28 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  42.11 
 
 		 460 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  44.85 
 
 		 457 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  39.74 
 
 		 498 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  45.74 
 
 		 453 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  39.46 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  43.17 
 
 		 448 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  40.28 
 
 		 741 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  42.75 
 
 		 414 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  38.98 
 
 		 437 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  45.3 
 
 		 404 aa  116  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  42.86 
 
 		 438 aa  115  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  41.33 
 
 		 417 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>