More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1225 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  100 
 
 
452 aa  870    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  66.89 
 
 
448 aa  617  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  42.63 
 
 
447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  42.63 
 
 
452 aa  338  8e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  41.98 
 
 
450 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  41.5 
 
 
447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  36.05 
 
 
451 aa  288  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  35.88 
 
 
496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  36.44 
 
 
455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  36.44 
 
 
455 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  36.49 
 
 
467 aa  257  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  32.29 
 
 
458 aa  246  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  34.31 
 
 
456 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  33.72 
 
 
442 aa  244  3e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  33.56 
 
 
455 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  33.18 
 
 
455 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  33.26 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  32.37 
 
 
448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  33.41 
 
 
452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  33.18 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  32.74 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  33.85 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  33.63 
 
 
451 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  33.63 
 
 
451 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  33.63 
 
 
451 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  33.63 
 
 
451 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  33.18 
 
 
451 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  32.96 
 
 
451 aa  230  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  34.09 
 
 
456 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  33.41 
 
 
445 aa  227  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  31.38 
 
 
448 aa  226  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  31.21 
 
 
450 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  31.31 
 
 
451 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  31.21 
 
 
450 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  31.31 
 
 
451 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  32.87 
 
 
449 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  33.18 
 
 
440 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  33.64 
 
 
464 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  31.21 
 
 
450 aa  223  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  33.11 
 
 
442 aa  222  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  31.28 
 
 
454 aa  221  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  32.37 
 
 
449 aa  220  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  30.07 
 
 
447 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  31.79 
 
 
456 aa  219  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.31 
 
 
451 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  32.95 
 
 
455 aa  219  7.999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  30.29 
 
 
447 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  31.39 
 
 
449 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  29.62 
 
 
449 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  32.26 
 
 
460 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  31.26 
 
 
455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  32.82 
 
 
477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  29.28 
 
 
448 aa  217  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  31.08 
 
 
451 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  29.48 
 
 
448 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  34.21 
 
 
459 aa  213  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  33.26 
 
 
461 aa  212  9e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  32.44 
 
 
455 aa  206  6e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.72 
 
 
459 aa  205  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  30.34 
 
 
460 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  30.49 
 
 
448 aa  205  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  32.82 
 
 
447 aa  202  7e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  29.02 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  30.68 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  29.61 
 
 
464 aa  200  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  31.95 
 
 
440 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  31.75 
 
 
459 aa  196  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  28.6 
 
 
451 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  27.19 
 
 
446 aa  194  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  28.51 
 
 
496 aa  194  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  30.63 
 
 
468 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  30.79 
 
 
454 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  33.41 
 
 
462 aa  192  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  30.28 
 
 
465 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  30.61 
 
 
444 aa  186  8e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.38 
 
 
446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  30.49 
 
 
470 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  31.75 
 
 
435 aa  180  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  31.33 
 
 
451 aa  180  4.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.3 
 
 
434 aa  179  9e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  29.38 
 
 
456 aa  177  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.97 
 
 
472 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  27.78 
 
 
451 aa  176  9e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  32.25 
 
 
466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  31.6 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  30.75 
 
 
442 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  30.31 
 
 
460 aa  172  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  26.75 
 
 
466 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.98 
 
 
447 aa  169  7e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.99 
 
 
452 aa  169  9e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  27.98 
 
 
439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.37 
 
 
450 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.58 
 
 
467 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.53 
 
 
452 aa  163  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  25 
 
 
466 aa  160  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  27.27 
 
 
472 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  29.64 
 
 
451 aa  156  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
493 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  30.73 
 
 
460 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  28.13 
 
 
467 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>