More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3794 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  100 
 
 
369 aa  729    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  46.9 
 
 
388 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  44.99 
 
 
389 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  45.82 
 
 
390 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  48.91 
 
 
369 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  42.97 
 
 
387 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  46.53 
 
 
325 aa  257  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  41.71 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  45.34 
 
 
405 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  44.9 
 
 
345 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  41.27 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  47.03 
 
 
391 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  33 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  36.07 
 
 
367 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  38.08 
 
 
348 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  40.89 
 
 
324 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  38.14 
 
 
326 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  38.26 
 
 
328 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  40.2 
 
 
355 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  33.49 
 
 
327 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  39.17 
 
 
338 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  39.9 
 
 
323 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  39.9 
 
 
323 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  33 
 
 
321 aa  149  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  41.03 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  36.26 
 
 
388 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  42.86 
 
 
320 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  37.44 
 
 
352 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  41.33 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  41.33 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  36.09 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  40.67 
 
 
322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  31.77 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  36.24 
 
 
336 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  35.78 
 
 
328 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  31.14 
 
 
329 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  31.14 
 
 
329 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  38.22 
 
 
327 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  36.7 
 
 
336 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  38.22 
 
 
327 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  38.83 
 
 
336 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  31.92 
 
 
328 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  34.44 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  32.49 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  34.22 
 
 
336 aa  137  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  34.8 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  34.88 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  36 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  35.94 
 
 
322 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  39.08 
 
 
239 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  35.75 
 
 
328 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  36.07 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  34.4 
 
 
336 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  36.24 
 
 
335 aa  130  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  32 
 
 
326 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  32.86 
 
 
322 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  36.52 
 
 
325 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  32.6 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  37.39 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  36.69 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  33.65 
 
 
332 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  32.97 
 
 
419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  40.31 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  39.05 
 
 
468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  38.92 
 
 
424 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  39.06 
 
 
425 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 
459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  33.75 
 
 
425 aa  109  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  37.93 
 
 
430 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  41.61 
 
 
426 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  36.16 
 
 
451 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  36.9 
 
 
477 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  35.78 
 
 
419 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  37.95 
 
 
493 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
243 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  32.06 
 
 
450 aa  100  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  29.91 
 
 
410 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.88 
 
 
810 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  27.81 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  32.34 
 
 
405 aa  96.3  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  31.96 
 
 
407 aa  95.9  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  31.96 
 
 
407 aa  95.9  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  35.23 
 
 
776 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  31.96 
 
 
407 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.4 
 
 
738 aa  95.1  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.65 
 
 
806 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  33 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.59 
 
 
727 aa  95.1  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  36.05 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  32.32 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.42 
 
 
718 aa  95.1  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.31 
 
 
768 aa  95.1  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  32.83 
 
 
464 aa  94.7  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  27.01 
 
 
410 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  38.01 
 
 
678 aa  94  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  37.64 
 
 
639 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.5 
 
 
769 aa  93.6  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  28.17 
 
 
407 aa  93.6  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  31.34 
 
 
405 aa  93.2  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  30.12 
 
 
379 aa  93.6  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>