More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3302 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  100 
 
 		 190 aa  396  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  70.37 
 
 		 190 aa  291  3e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  50 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  50.55 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  47.34 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  47.34 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  47.34 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  47.34 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  47.34 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  46.28 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  44.21 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  45.6 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  45.08 
 
 		 199 aa  158  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  42.11 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  43.98 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  45.2 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  41.44 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  41.44 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  40.88 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  40.88 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  40.61 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  42.63 
 
 		 200 aa  138  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  41.4 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  39.25 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  39.25 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  42.25 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 187 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  43.41 
 
 		 187 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  39.04 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  40.84 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  38.02 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  41.4 
 
 		 187 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  39.25 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  39.78 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  41.21 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  36.57 
 
 		 166 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  27.27 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  24.73 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  26.37 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  26.37 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  30.62 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  26.67 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  25.65 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  28.02 
 
 		 533 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  38.54 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  29.3 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.25 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  36.61 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  28.57 
 
 		 389 aa  75.5  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  23.66 
 
 		 287 aa  75.1  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  27.09 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  31.79 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  25.26 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  27.17 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  26.42 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  25.41 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  25.41 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  38.46 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  25.41 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  25.41 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  25.41 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  25.41 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  25.41 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>