More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0098 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  100 
 
 
465 aa  956    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  52.17 
 
 
464 aa  474  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  49.67 
 
 
457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  44.15 
 
 
502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  47.3 
 
 
925 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  46.4 
 
 
925 aa  381  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  45.21 
 
 
957 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  44.94 
 
 
926 aa  363  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  43.24 
 
 
591 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  42.86 
 
 
589 aa  332  6e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  41.57 
 
 
597 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  43.3 
 
 
598 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  38.55 
 
 
598 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  38.57 
 
 
598 aa  323  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  39.41 
 
 
596 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  41.26 
 
 
504 aa  316  7e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.34 
 
 
593 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  37.11 
 
 
589 aa  306  7e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  36.87 
 
 
596 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  36.85 
 
 
588 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.62 
 
 
596 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  37.95 
 
 
596 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  38.53 
 
 
596 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  37.1 
 
 
583 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  37.95 
 
 
596 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  37.95 
 
 
596 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  37.95 
 
 
596 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  38.31 
 
 
596 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  37.33 
 
 
596 aa  300  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  38.31 
 
 
596 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  36.41 
 
 
596 aa  299  8e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  37.95 
 
 
597 aa  298  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  37.59 
 
 
608 aa  296  5e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  35.88 
 
 
596 aa  296  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  39.01 
 
 
589 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  36.54 
 
 
599 aa  259  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  35.58 
 
 
584 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  36.32 
 
 
582 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  35.08 
 
 
637 aa  239  9e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  37.04 
 
 
586 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  36.38 
 
 
582 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  36.23 
 
 
586 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  35.43 
 
 
668 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  33.91 
 
 
609 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  33.04 
 
 
635 aa  226  8e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  35.24 
 
 
591 aa  221  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  32.34 
 
 
587 aa  219  7.999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  32.34 
 
 
587 aa  219  7.999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  37.04 
 
 
582 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  37.04 
 
 
582 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  31.53 
 
 
627 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  36.6 
 
 
582 aa  216  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  35.1 
 
 
561 aa  215  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  32.23 
 
 
484 aa  213  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  32.1 
 
 
519 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  29.77 
 
 
519 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  32.11 
 
 
616 aa  207  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  32.48 
 
 
605 aa  206  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  30.43 
 
 
659 aa  204  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.77 
 
 
478 aa  202  7e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  34.12 
 
 
603 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  30.8 
 
 
517 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  30.19 
 
 
517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  30.8 
 
 
517 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  29.92 
 
 
519 aa  196  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  32.32 
 
 
515 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.87 
 
 
616 aa  193  5e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  32.54 
 
 
515 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  32.33 
 
 
515 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  32.09 
 
 
631 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  30.67 
 
 
517 aa  190  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  32.31 
 
 
606 aa  190  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.72 
 
 
577 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  31.1 
 
 
500 aa  186  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  29.86 
 
 
650 aa  184  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  28.26 
 
 
1005 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  30.8 
 
 
499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  30.61 
 
 
510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  32.33 
 
 
515 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  29.26 
 
 
483 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  31.16 
 
 
500 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  27.49 
 
 
1004 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  32.56 
 
 
512 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  29.79 
 
 
511 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  28.1 
 
 
507 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  28.51 
 
 
517 aa  156  6e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  29.81 
 
 
506 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  28.94 
 
 
494 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.39 
 
 
542 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  29.5 
 
 
506 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  28.6 
 
 
568 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  26.67 
 
 
521 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  28.45 
 
 
518 aa  153  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.59 
 
 
646 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  29.28 
 
 
506 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  29.59 
 
 
506 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.67 
 
 
493 aa  149  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  30.09 
 
 
506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  29.61 
 
 
506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.28 
 
 
482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>