More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0862 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  58.67 
 
 		 229 aa  277  1e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  55.8 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  48.43 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  47.73 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  50.46 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  49.28 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  45.58 
 
 		 243 aa  204  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  45.58 
 
 		 243 aa  204  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  48.1 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  48.57 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  48.57 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  48.57 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  48.57 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  48.1 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  48.57 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  48.57 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  48.57 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  45.74 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  47.57 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  48.57 
 
 		 245 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  49.52 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  45.5 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  47.73 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0780  ribonuclease III  48.57 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.30965e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  40.09 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  46.01 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  42.01 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  41.59 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  44.5 
 
 		 236 aa  178  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  39.38 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  42.27 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1565  ribonuclease III  43.35 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  42.22 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  41.36 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  42.15 
 
 		 245 aa  169  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  41.55 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  39.81 
 
 		 235 aa  167  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  40.91 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  43 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  41.83 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  38.39 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  41.18 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  40.28 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  40.28 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  41.74 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  41.55 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  38.64 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  36.28 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  41.01 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  39.63 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  41.82 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  39.37 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  39.29 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  45.77 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  38.94 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  39.38 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  40.27 
 
 		 248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  37.78 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  40.99 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  37.79 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  40.89 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  38.16 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  37.22 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  36.32 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  39.62 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  41.55 
 
 		 276 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  37.89 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  38.05 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  41.98 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  37.39 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  39.42 
 
 		 223 aa  149  5e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  38.01 
 
 		 377 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  37.78 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  38.1 
 
 		 273 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  37.26 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  39.47 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  37.28 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  37.93 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  36.84 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  37.14 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  37.28 
 
 		 226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  40.58 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  37.33 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  37.04 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  36.57 
 
 		 385 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  37.33 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  36.57 
 
 		 383 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  39.07 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  36.67 
 
 		 282 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  36.57 
 
 		 383 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  40.09 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0659  ribonuclease III  39.44 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0117044  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  36.23 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  39.53 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  39.53 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0492  ribonuclease III  35.65 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.863648  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  35.85 
 
 		 300 aa  141  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  37.31 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  39.2 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>