68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2321 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
701 aa  1378    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  29.22 
 
 
480 aa  97.4  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  32.51 
 
 
448 aa  90.5  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  29.43 
 
 
771 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  28.88 
 
 
3507 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  35.32 
 
 
1199 aa  74.7  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  27.36 
 
 
9585 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  30.19 
 
 
1042 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  27.1 
 
 
1247 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  29.85 
 
 
2170 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  28.5 
 
 
2068 aa  65.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1705  hypothetical protein  28.87 
 
 
548 aa  64.7  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  28.26 
 
 
1248 aa  63.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  25.19 
 
 
680 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  27.03 
 
 
527 aa  62.4  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  29.46 
 
 
3333 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  25.37 
 
 
1973 aa  59.3  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  27.92 
 
 
670 aa  59.3  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  29.93 
 
 
2043 aa  57.8  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  23.31 
 
 
903 aa  57.4  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.12 
 
 
6885 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  31.51 
 
 
801 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  33.64 
 
 
340 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  29.15 
 
 
4433 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  28.63 
 
 
2039 aa  55.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  28.27 
 
 
836 aa  55.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  27.75 
 
 
1380 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  27.27 
 
 
1363 aa  53.9  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  26.98 
 
 
803 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  26.8 
 
 
779 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  31.69 
 
 
409 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  28.99 
 
 
2334 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.84 
 
 
649 aa  52.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  23.45 
 
 
741 aa  51.6  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  35.64 
 
 
14944 aa  51.2  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  26.11 
 
 
1363 aa  51.2  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  27.51 
 
 
1628 aa  50.8  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  28.64 
 
 
743 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  29.48 
 
 
2052 aa  49.7  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  28.65 
 
 
1735 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  34.64 
 
 
2286 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  38.37 
 
 
880 aa  48.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 
776 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  28.57 
 
 
995 aa  47.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  28.57 
 
 
1063 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.83 
 
 
795 aa  47.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  26.21 
 
 
744 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  25.87 
 
 
1113 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  27.27 
 
 
1224 aa  47  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  30 
 
 
1462 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  36.08 
 
 
648 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  28.63 
 
 
938 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  26.87 
 
 
3802 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  33.08 
 
 
868 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  24.72 
 
 
2069 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  28.88 
 
 
2056 aa  45.8  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  26.86 
 
 
2047 aa  45.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  27.61 
 
 
2011 aa  45.8  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  45.59 
 
 
1299 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  34.44 
 
 
1430 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  29.7 
 
 
841 aa  45.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  29.44 
 
 
861 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  30.16 
 
 
973 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  26.11 
 
 
825 aa  44.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  26 
 
 
999 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  24.76 
 
 
455 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  25 
 
 
428 aa  43.9  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  29.21 
 
 
2067 aa  43.9  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>