More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1392 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 251 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  40.4 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  40.8 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  40.8 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 234 aa  121  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  39.3 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  39.3 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 243 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 216 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  36.26 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  37.64 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  34.8 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  36.26 
 
 		 224 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  32.99 
 
 		 227 aa  104  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  34.57 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  36.98 
 
 		 230 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  42.24 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  36.42 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  36.13 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 265 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 		 295 aa  95.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 		 255 aa  95.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 222 aa  91.7  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  28.37 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 224 aa  89  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 224 aa  89  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 244 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>