More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1918 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  100 
 
 
236 aa  474  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  80.09 
 
 
240 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  75 
 
 
236 aa  348  6e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  72.22 
 
 
235 aa  331  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  70.56 
 
 
244 aa  329  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  69.7 
 
 
245 aa  328  7e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  71.43 
 
 
238 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  69.26 
 
 
251 aa  324  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  68.83 
 
 
235 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  71.3 
 
 
248 aa  315  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  72.34 
 
 
241 aa  315  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  71.3 
 
 
244 aa  314  7e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  71.3 
 
 
244 aa  314  8e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  68.51 
 
 
240 aa  314  9e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  63.64 
 
 
251 aa  310  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  65.24 
 
 
235 aa  305  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  67.1 
 
 
254 aa  304  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  61.9 
 
 
244 aa  300  9e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  63.56 
 
 
244 aa  300  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  66.23 
 
 
240 aa  300  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  64.5 
 
 
253 aa  297  9e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  64.94 
 
 
245 aa  297  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  64.38 
 
 
234 aa  294  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  64.94 
 
 
238 aa  294  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  64.38 
 
 
234 aa  294  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  69.3 
 
 
250 aa  294  7e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  62.34 
 
 
248 aa  294  9e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  64.5 
 
 
245 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  59.75 
 
 
236 aa  291  7e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  62.17 
 
 
245 aa  290  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  64.78 
 
 
241 aa  289  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  64.94 
 
 
253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  65.37 
 
 
243 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  62.66 
 
 
234 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  65.37 
 
 
238 aa  281  7.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  63.52 
 
 
234 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  56.89 
 
 
236 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  53.68 
 
 
234 aa  261  8e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  56.56 
 
 
239 aa  257  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  52.94 
 
 
236 aa  256  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  51.56 
 
 
233 aa  253  3e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.78 
 
 
233 aa  250  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  50.22 
 
 
233 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 
233 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 
233 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  50.42 
 
 
234 aa  245  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  52 
 
 
233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  47.35 
 
 
234 aa  241  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  51.57 
 
 
233 aa  240  2e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  46.29 
 
 
233 aa  238  9e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  51.56 
 
 
233 aa  235  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  51.49 
 
 
236 aa  235  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  51.29 
 
 
235 aa  235  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  48.91 
 
 
234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  47.79 
 
 
233 aa  232  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  48.66 
 
 
233 aa  231  8.000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 
233 aa  229  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  48.66 
 
 
236 aa  228  8e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  48 
 
 
232 aa  226  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 
233 aa  226  3e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  48.44 
 
 
232 aa  222  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.81 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  45.41 
 
 
232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.07 
 
 
236 aa  217  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  42.74 
 
 
604 aa  217  2e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  49.15 
 
 
238 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 
246 aa  215  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  49.33 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  50.67 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 
345 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.46 
 
 
234 aa  209  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.46 
 
 
234 aa  209  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  49.32 
 
 
244 aa  209  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  51.35 
 
 
247 aa  208  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  44.73 
 
 
256 aa  208  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.46 
 
 
230 aa  207  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  47.53 
 
 
232 aa  207  9e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 
248 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  47.3 
 
 
230 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  46.43 
 
 
252 aa  206  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  45.05 
 
 
229 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.13 
 
 
230 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  51.6 
 
 
225 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  48.64 
 
 
240 aa  205  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  46.61 
 
 
237 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  45.41 
 
 
226 aa  205  6e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  48.85 
 
 
242 aa  204  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  44.93 
 
 
249 aa  204  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.13 
 
 
225 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.15 
 
 
226 aa  204  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.2 
 
 
239 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48.4 
 
 
252 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
228 aa  204  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
319 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  43.17 
 
 
286 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  42.02 
 
 
300 aa  203  2e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  48.48 
 
 
237 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  44.84 
 
 
242 aa  202  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  50.23 
 
 
288 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  44.54 
 
 
234 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>