More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2045 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  73.75 
 
 		 910 aa  1278    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  67.1 
 
 		 1087 aa  1456    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  59.22 
 
 		 1082 aa  1249    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  58.43 
 
 		 1083 aa  1248    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  70.34 
 
 		 1100 aa  1513    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  53.42 
 
 		 671 aa  718    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  66.73 
 
 		 1087 aa  1454    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 1079 aa  2205    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.1 
 
 		 919 aa  589  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  44.94 
 
 		 927 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  45.13 
 
 		 919 aa  582  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  46.09 
 
 		 1088 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  41.44 
 
 		 906 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  43.69 
 
 		 913 aa  545  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  43.41 
 
 		 903 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 		 920 aa  522  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 1071 aa  516  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 917 aa  509  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  42.76 
 
 		 935 aa  508  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  43.64 
 
 		 1039 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 932 aa  501  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  39.28 
 
 		 1323 aa  485  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 		 901 aa  476  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.2 
 
 		 1323 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 		 1172 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 		 945 aa  466  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 897 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1316 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 		 1170 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 894 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  35.47 
 
 		 894 aa  439  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 894 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 1069 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.17 
 
 		 1070 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1163 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 1069 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.095908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 896 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 1070 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 1169 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 893 aa  405  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 1169 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 		 1169 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 1168 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  34.74 
 
 		 1169 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  36.01 
 
 		 1174 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  36.34 
 
 		 1150 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  33.66 
 
 		 950 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 1169 aa  392  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 1152 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1168 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.14 
 
 		 1168 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 1172 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 1167 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  36.52 
 
 		 1159 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 1171 aa  379  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  36.52 
 
 		 1159 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 1174 aa  380  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1156 aa  376  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1168 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1175 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1168 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1172 aa  373  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.01 
 
 		 1169 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  35.36 
 
 		 1157 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.36 
 
 		 1158 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.14 
 
 		 1179 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 1159 aa  365  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 1159 aa  365  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 1158 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 1159 aa  363  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  35.78 
 
 		 1147 aa  363  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  48.67 
 
 		 366 aa  362  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 1177 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  34.58 
 
 		 1146 aa  352  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 1146 aa  352  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 1146 aa  351  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  35.27 
 
 		 1161 aa  351  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  35 
 
 		 1142 aa  350  9e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  33.77 
 
 		 1145 aa  349  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  36.02 
 
 		 1177 aa  349  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 1140 aa  347  8e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 1146 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 1140 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 885 aa  345  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00597808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 1146 aa  344  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 1140 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 1159 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1145 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 1146 aa  334  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.75 
 
 		 1156 aa  334  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  34.69 
 
 		 1148 aa  332  3e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 1146 aa  330  8e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  33.03 
 
 		 1141 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  60.78 
 
 		 637 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.48 
 
 		 1184 aa  317  9e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 1185 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 1145 aa  312  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 1138 aa  311  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 		 1166 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 		 1161 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.305564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>