More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0749 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  100 
 
 		 722 aa  1441    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  28.79 
 
 		 720 aa  281  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  29.13 
 
 		 719 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  32.47 
 
 		 679 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  29.35 
 
 		 796 aa  256  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  29.29 
 
 		 723 aa  225  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  25.52 
 
 		 756 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  24.19 
 
 		 674 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  29.64 
 
 		 738 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  26.24 
 
 		 684 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4587  histidine kinase  24.41 
 
 		 784 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  24.11 
 
 		 946 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  30.09 
 
 		 771 aa  125  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  26.08 
 
 		 773 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  27.06 
 
 		 989 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  28.06 
 
 		 774 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  25.92 
 
 		 783 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  24.82 
 
 		 774 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  26.01 
 
 		 971 aa  108  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 553 aa  105  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  31.01 
 
 		 630 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  24.89 
 
 		 987 aa  105  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  32.19 
 
 		 625 aa  102  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 622 aa  100  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  31.76 
 
 		 625 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 618 aa  100  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  32.53 
 
 		 1836 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3152  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 473 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 799 aa  97.8  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 519 aa  97.8  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4771  histidine kinase  37.28 
 
 		 624 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.415438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 494 aa  97.4  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1376  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 499 aa  97.4  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.20257  normal  0.926367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  32.51 
 
 		 621 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 571 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.36 
 
 		 857 aa  95.5  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  32.51 
 
 		 626 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 858 aa  94.7  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  30.04 
 
 		 630 aa  94.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 755 aa  94.4  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 720 aa  94  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 471 aa  94  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 683 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 603 aa  93.6  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 842 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 513 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 592 aa  93.2  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  27.52 
 
 		 600 aa  92.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 635 aa  92  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 845 aa  92  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001013  signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 624 aa  92  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  28.31 
 
 		 615 aa  91.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 511 aa  90.9  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 368 aa  90.9  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 839 aa  90.9  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2443  histidine kinase  31.19 
 
 		 578 aa  90.5  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 680 aa  90.1  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.71 
 
 		 1710 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  31.69 
 
 		 621 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 512 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 598 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 963 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 598 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  29.55 
 
 		 600 aa  89.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 495 aa  89.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 598 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0208  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 708 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.832424 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  25.73 
 
 		 598 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 551 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  29.67 
 
 		 483 aa  89.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 		 607 aa  89  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 793 aa  88.6  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  30.24 
 
 		 623 aa  88.6  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 870 aa  89  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 692 aa  89  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4081 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  27.03 
 
 		 604 aa  89  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 603 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0246  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 573 aa  89  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 571 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  28.23 
 
 		 622 aa  88.2  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 603 aa  88.2  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 871 aa  87.8  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  26.92 
 
 		 496 aa  87.8  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 372 aa  87.8  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 457 aa  87.8  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  25.73 
 
 		 603 aa  87.4  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  25.91 
 
 		 608 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.91 
 
 		 608 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 537 aa  86.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 508 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  25.91 
 
 		 608 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  25.91 
 
 		 608 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  25.91 
 
 		 608 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.24 
 
 		 598 aa  87  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  30.89 
 
 		 577 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 1519 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 577 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  29.39 
 
 		 591 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  29.89 
 
 		 548 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>