More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3468 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 448 aa  896    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  48.41 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  48.07 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  40.22 
 
 		 458 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  42.86 
 
 		 447 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  42.28 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  29.69 
 
 		 441 aa  142  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 458 aa  132  9e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 441 aa  99.8  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.11 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  29.78 
 
 		 446 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  26.05 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  26.05 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  25.27 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  25.94 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 453 aa  92.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 		 439 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  22.67 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  21.3 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  28.17 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  28.62 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3941  outer membrane efflux protein  29.03 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  27.69 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.14 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1690  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  28.18 
 
 		 462 aa  73.6  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  27.78 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.04 
 
 		 491 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4084  outer membrane efflux protein  30.3 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 		 565 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4051  outer membrane efflux protein  30.41 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337744  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  26.23 
 
 		 500 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  26.77 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  24.33 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  29.95 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4684  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.72 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 467 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 497 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.25 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 627 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  20.81 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.92 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.95 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  28.68 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  27.74 
 
 		 731 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.99 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  27.11 
 
 		 525 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  24.39 
 
 		 535 aa  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.71 
 
 		 470 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  23.88 
 
 		 488 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  27.43 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  26.23 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 972 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.04 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.43 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.82 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  21.81 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  25.38 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.8 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.8 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.81 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.39 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.39 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>