More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1828 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  39.5 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  34.51 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  34.51 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  28.47 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  26.13 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 241 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0332  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0327  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 291 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  22.97 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 403 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  35.29 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>