126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1896 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  42.27 
 
 
1219 aa  954    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  42.17 
 
 
1219 aa  952    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  42.25 
 
 
1219 aa  954    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  42.17 
 
 
1219 aa  953    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  42.17 
 
 
1219 aa  952    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  53.7 
 
 
1249 aa  1283    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  42.08 
 
 
1219 aa  946    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  42.11 
 
 
1219 aa  927    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  42.27 
 
 
1219 aa  956    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  41.95 
 
 
1219 aa  937    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  42.17 
 
 
1219 aa  943    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  42.25 
 
 
1219 aa  951    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  100 
 
 
1228 aa  2544    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  25.92 
 
 
1146 aa  360  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  25.92 
 
 
1146 aa  360  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  26.17 
 
 
1145 aa  340  7e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  30.45 
 
 
648 aa  249  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0968  small GTP-binding protein  28.54 
 
 
501 aa  155  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  28.74 
 
 
655 aa  84  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  30.12 
 
 
605 aa  83.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  26.34 
 
 
444 aa  81.6  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  28.92 
 
 
603 aa  80.1  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  25.58 
 
 
789 aa  80.1  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  23.67 
 
 
741 aa  78.2  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  29.65 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  27.87 
 
 
585 aa  74.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  25.66 
 
 
614 aa  72.8  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  25.66 
 
 
614 aa  72.8  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  27.37 
 
 
614 aa  72.4  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  25.29 
 
 
564 aa  69.7  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  26.82 
 
 
588 aa  69.3  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  22.41 
 
 
728 aa  69.3  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  24.52 
 
 
692 aa  69.7  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  31.22 
 
 
585 aa  68.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  30.46 
 
 
615 aa  68.6  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  22.32 
 
 
728 aa  68.2  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  25 
 
 
952 aa  66.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  22.03 
 
 
728 aa  66.2  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  33.08 
 
 
620 aa  65.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1925  hypothetical protein  21.29 
 
 
788 aa  65.1  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  hitchhiker  0.0041869 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  28.26 
 
 
674 aa  64.3  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  24.52 
 
 
692 aa  63.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  28.16 
 
 
548 aa  63.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  29.1 
 
 
585 aa  63.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  27.03 
 
 
793 aa  62.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  37.29 
 
 
666 aa  62.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.57 
 
 
587 aa  62.4  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1070  hypothetical protein  23.7 
 
 
798 aa  61.6  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0611355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.88 
 
 
546 aa  61.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  26.23 
 
 
583 aa  61.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  23.02 
 
 
693 aa  60.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  28.04 
 
 
686 aa  60.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  25.6 
 
 
551 aa  60.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  26.32 
 
 
664 aa  58.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  21.92 
 
 
506 aa  58.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4311  hypothetical protein  26.73 
 
 
768 aa  58.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  22.6 
 
 
712 aa  57.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  22.6 
 
 
712 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  31.62 
 
 
610 aa  57.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  26.29 
 
 
390 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  32.14 
 
 
601 aa  55.8  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  37.68 
 
 
679 aa  55.5  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0922  hypothetical protein  22.07 
 
 
766 aa  54.3  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229589 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0312  hypothetical protein  25.16 
 
 
784 aa  54.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0131093 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.96 
 
 
550 aa  54.3  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  27.91 
 
 
524 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0374  hypothetical protein  23.92 
 
 
621 aa  53.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1396  hypothetical protein  24.75 
 
 
794 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.318277 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  23.81 
 
 
632 aa  53.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  21.97 
 
 
407 aa  53.1  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  24.38 
 
 
523 aa  53.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  24.09 
 
 
589 aa  52.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  22.12 
 
 
525 aa  52.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  22.12 
 
 
525 aa  52.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  25.27 
 
 
552 aa  52  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  22.12 
 
 
525 aa  52.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  28 
 
 
976 aa  52.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  28.8 
 
 
420 aa  51.6  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  34.18 
 
 
693 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  23.78 
 
 
542 aa  50.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.25 
 
 
431 aa  50.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  30.25 
 
 
599 aa  50.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  27.27 
 
 
743 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3138  hypothetical protein  25 
 
 
788 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0143921  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  25.37 
 
 
568 aa  49.7  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  23.56 
 
 
1164 aa  50.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  23.84 
 
 
602 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  23.79 
 
 
914 aa  49.7  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  23.77 
 
 
649 aa  49.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3684  hypothetical protein  23.53 
 
 
794 aa  49.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2958  GTPase  22.94 
 
 
768 aa  49.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000016463  unclonable  0.0000121851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  23.78 
 
 
539 aa  49.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  23.68 
 
 
658 aa  48.9  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  25.17 
 
 
602 aa  48.5  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4574  hypothetical protein  23.2 
 
 
742 aa  48.5  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5622  hypothetical protein  23.2 
 
 
742 aa  48.5  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.889676 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3883  conserved hypothetical protein  23.2 
 
 
742 aa  48.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  23.03 
 
 
309 aa  47.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  27.61 
 
 
501 aa  47.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  22.78 
 
 
655 aa  48.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>