More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1561 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 662 aa  1345    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  74.01 
 
 		 667 aa  1023    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  76.85 
 
 		 693 aa  1035    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  66.36 
 
 		 701 aa  882    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  66.46 
 
 		 744 aa  884    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  64.38 
 
 		 656 aa  839    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  68.42 
 
 		 704 aa  929    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  38.27 
 
 		 648 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  38.76 
 
 		 661 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  39.14 
 
 		 646 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  37.56 
 
 		 649 aa  409  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  36.51 
 
 		 668 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  39.37 
 
 		 757 aa  392  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  37.16 
 
 		 751 aa  388  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.57 
 
 		 806 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37.17 
 
 		 618 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  38.64 
 
 		 713 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  38.64 
 
 		 713 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  38.64 
 
 		 713 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  38.58 
 
 		 713 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  38.58 
 
 		 713 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  38.58 
 
 		 713 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.83 
 
 		 765 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  38.62 
 
 		 709 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  37.23 
 
 		 727 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  38.62 
 
 		 709 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.42 
 
 		 761 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  37.93 
 
 		 707 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  37.24 
 
 		 710 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  38.62 
 
 		 709 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  39.06 
 
 		 654 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  38.62 
 
 		 705 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  37.35 
 
 		 681 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  37.1 
 
 		 648 aa  372  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  38.51 
 
 		 714 aa  369  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  36.87 
 
 		 683 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  38.28 
 
 		 714 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  38.06 
 
 		 712 aa  365  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  35.46 
 
 		 683 aa  362  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.54 
 
 		 643 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.54 
 
 		 643 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.19 
 
 		 643 aa  360  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  35.35 
 
 		 683 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  39.57 
 
 		 734 aa  357  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  36.48 
 
 		 905 aa  356  6.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  35.19 
 
 		 683 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  35.35 
 
 		 683 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  35.57 
 
 		 683 aa  355  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  35.35 
 
 		 683 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  35.35 
 
 		 683 aa  355  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  35.35 
 
 		 683 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  35.51 
 
 		 683 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  35.51 
 
 		 683 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  35.8 
 
 		 855 aa  353  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  35.51 
 
 		 683 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  34.85 
 
 		 665 aa  352  1e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.63 
 
 		 640 aa  352  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  35.96 
 
 		 655 aa  351  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  34.21 
 
 		 828 aa  351  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  36.23 
 
 		 676 aa  350  5e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  38.57 
 
 		 860 aa  350  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  35.15 
 
 		 705 aa  349  9e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  36.41 
 
 		 861 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  37.76 
 
 		 679 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.68 
 
 		 776 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  34.71 
 
 		 641 aa  345  1e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  36.47 
 
 		 727 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  38.55 
 
 		 853 aa  343  5e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  35.86 
 
 		 952 aa  343  5.999999999999999e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  33.18 
 
 		 713 aa  343  7e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  36.22 
 
 		 811 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  34.89 
 
 		 829 aa  342  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  37.37 
 
 		 625 aa  342  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  38.92 
 
 		 723 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  36.53 
 
 		 730 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  37.35 
 
 		 626 aa  340  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  36.53 
 
 		 763 aa  340  5.9999999999999996e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  37.21 
 
 		 770 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  36.22 
 
 		 640 aa  339  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  34.07 
 
 		 814 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  36.44 
 
 		 687 aa  337  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  37.57 
 
 		 739 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  35.35 
 
 		 642 aa  335  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  37.66 
 
 		 735 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  38.37 
 
 		 732 aa  333  5e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  37.71 
 
 		 691 aa  333  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  35.96 
 
 		 710 aa  333  6e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  37.34 
 
 		 720 aa  333  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  39.62 
 
 		 712 aa  332  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  36.38 
 
 		 755 aa  331  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  35.63 
 
 		 778 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  37.34 
 
 		 734 aa  330  4e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  34.9 
 
 		 761 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  35.57 
 
 		 680 aa  330  5.0000000000000004e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  34.59 
 
 		 638 aa  329  8e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  31.84 
 
 		 760 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  34.33 
 
 		 642 aa  328  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  34.08 
 
 		 890 aa  327  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  36.19 
 
 		 824 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  37.31 
 
 		 677 aa  326  9e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>