More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3790 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  226  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  58 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  54.74 
 
 		 99 aa  107  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.64 
 
 		 193 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  55.21 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  44 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 110 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  47.17 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  50.94 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 197 aa  87  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 169 aa  85.9  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  40.22 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  40.59 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  44.25 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  41.24 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  26.13 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  41.84 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  30.85 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  44.44 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  41.76 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  38.94 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  40.86 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1541  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  39.36 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  38.3 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  42.2 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  30.39 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 86 aa  70.1  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  28.71 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5809  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522753  normal  0.488777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>