144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0753 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  52.68 
 
 		 271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  52.22 
 
 		 327 aa  202  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  57.52 
 
 		 351 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  44.39 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  40.57 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  36.56 
 
 		 178 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  41.84 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  41.84 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  44.16 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  39.29 
 
 		 346 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  41.78 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  39.86 
 
 		 175 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  40 
 
 		 350 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  40.43 
 
 		 191 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  40.26 
 
 		 374 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  27.23 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  41.3 
 
 		 324 aa  89  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  36.13 
 
 		 372 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  41.38 
 
 		 443 aa  85.9  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  42.34 
 
 		 323 aa  85.1  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  32.97 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  36.43 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  36.43 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  37.76 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  37.76 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  37.06 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  35 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  36.69 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  34.87 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  32.48 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  29.83 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  31.85 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  33.12 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  34.23 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  28.76 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  35 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  35.1 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  34 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  32 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  28.82 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  33.8 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  30 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  29.41 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  32.28 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  32.48 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  32.19 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  33.33 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  45.12 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  40 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  28.82 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  37.29 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  30.12 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  28.49 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  33.33 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  28.82 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  29.3 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  41.98 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  30.26 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  29.93 
 
 		 255 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  25.31 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  31.16 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  30.82 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  30.82 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  27.85 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  24.68 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  30.94 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  26.74 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.66 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  26.71 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  34 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  26.19 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.03 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  39.58 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.66 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  33.33 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  23.68 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  29.3 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  43.37 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  27.81 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  33.57 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  30.06 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  28.9 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  40.38 
 
 		 443 aa  53.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  27.27 
 
 		 148 aa  53.5  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  28.32 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  29.38 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  25 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  27.97 
 
 		 169 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1433  nuclease  30.61 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.218416  normal  0.0340527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  37.35 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  29.73 
 
 		 179 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  20.49 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  28.77 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  29.73 
 
 		 157 aa  49.7  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  29.71 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  28.48 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  26.47 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1274  nuclease  31.63 
 
 		 311 aa  48.9  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>