26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1433 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1433  nuclease  100 
 
 
206 aa  420  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.218416  normal  0.0340527 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1274  nuclease  94.41 
 
 
311 aa  281  5.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  34.12 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  40.28 
 
 
266 aa  48.9  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  37.23 
 
 
214 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  42.05 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  31.52 
 
 
259 aa  45.8  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  31.91 
 
 
351 aa  45.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  36.47 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  36.47 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  35.48 
 
 
276 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  33.33 
 
 
166 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.85 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  30.4 
 
 
346 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.78 
 
 
174 aa  43.9  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  27.85 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  32.89 
 
 
278 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  35.25 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  32.63 
 
 
350 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  38.55 
 
 
374 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  41.1 
 
 
327 aa  42.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  27.22 
 
 
175 aa  42.4  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  37.68 
 
 
169 aa  42.4  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  34.78 
 
 
148 aa  42  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  36.84 
 
 
271 aa  42  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  37.35 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>