88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0305 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 
522 aa  1063    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  62.48 
 
 
525 aa  688    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  60.23 
 
 
525 aa  649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  59.61 
 
 
525 aa  629  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.98 
 
 
532 aa  578  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.65 
 
 
529 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.79 
 
 
532 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.23 
 
 
530 aa  558  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.95 
 
 
532 aa  556  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.14 
 
 
529 aa  542  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  49.53 
 
 
530 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.19 
 
 
529 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.51 
 
 
546 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.59 
 
 
547 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.4 
 
 
546 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  45.54 
 
 
546 aa  435  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  44.59 
 
 
545 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.26 
 
 
545 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.86 
 
 
551 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  42.23 
 
 
547 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.21 
 
 
545 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  41.52 
 
 
544 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.78 
 
 
463 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.14 
 
 
463 aa  89.7  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.71 
 
 
461 aa  87  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.05 
 
 
461 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25.15 
 
 
529 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  25.37 
 
 
529 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.84 
 
 
514 aa  57.8  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.19 
 
 
516 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  26.58 
 
 
437 aa  57.4  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  24.85 
 
 
529 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.95 
 
 
516 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  25.51 
 
 
466 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.33 
 
 
516 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  23.28 
 
 
515 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.94 
 
 
502 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.63 
 
 
460 aa  53.5  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.13 
 
 
545 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.59 
 
 
546 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.19 
 
 
510 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.72 
 
 
440 aa  53.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.61 
 
 
547 aa  52.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.25 
 
 
466 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.4 
 
 
442 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.96 
 
 
441 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.85 
 
 
442 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  28.31 
 
 
442 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  27.51 
 
 
441 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.64 
 
 
442 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.96 
 
 
442 aa  50.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.9 
 
 
496 aa  50.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  22.79 
 
 
510 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.33 
 
 
444 aa  50.4  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.46 
 
 
455 aa  50.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.14 
 
 
447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.77 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.14 
 
 
447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.14 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.6 
 
 
458 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  28.82 
 
 
518 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.89 
 
 
492 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.11 
 
 
456 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.91 
 
 
441 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.91 
 
 
440 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  30.91 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.97 
 
 
445 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  26.15 
 
 
741 aa  47.8  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.45 
 
 
446 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  24 
 
 
500 aa  47.4  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  23.72 
 
 
747 aa  47  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  30.77 
 
 
684 aa  47  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.98 
 
 
441 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  23.95 
 
 
502 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  22.35 
 
 
510 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.03 
 
 
693 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25.35 
 
 
501 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.44 
 
 
535 aa  46.2  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  26.76 
 
 
500 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.21 
 
 
510 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  29.69 
 
 
564 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  28.43 
 
 
507 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  28.43 
 
 
507 aa  45.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.49 
 
 
442 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  30.93 
 
 
501 aa  44.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  27.62 
 
 
500 aa  44.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.32 
 
 
547 aa  44.3  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  23.49 
 
 
712 aa  43.5  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>