More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2964 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  48.4 
 
 		 255 aa  158  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.81 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 298 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  42.47 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  40.54 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  54.92 
 
 		 265 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  38.28 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  39.5 
 
 		 303 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  51.28 
 
 		 333 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  47.45 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  33.03 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  37.22 
 
 		 295 aa  118  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 257 aa  118  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  33.64 
 
 		 346 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  46.61 
 
 		 391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 342 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 342 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  32.27 
 
 		 341 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  32.61 
 
 		 347 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 424 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  45.59 
 
 		 274 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  50.86 
 
 		 181 aa  108  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  36.1 
 
 		 338 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  42.76 
 
 		 370 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  31.56 
 
 		 349 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 319 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 150 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  49.09 
 
 		 365 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  49.09 
 
 		 365 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  36.27 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  40 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  36.81 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  36.42 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  36.42 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  36.42 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  36.42 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  36.42 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  36.42 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  36.42 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  36.42 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  36.42 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 150 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  42.99 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  42.99 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  38.19 
 
 		 166 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  42.99 
 
 		 172 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  47.15 
 
 		 296 aa  101  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  37.42 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  33.52 
 
 		 333 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  35.9 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  37.78 
 
 		 147 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  35.9 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  40.52 
 
 		 162 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  39.23 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  35.9 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  35.56 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  38.36 
 
 		 476 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  37.78 
 
 		 147 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  47.32 
 
 		 363 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  46.43 
 
 		 354 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  47.32 
 
 		 363 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 454 aa  99  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  47.32 
 
 		 363 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  43.8 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 188 aa  98.6  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 325 aa  98.6  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  45.54 
 
 		 353 aa  97.8  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 164 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  50.59 
 
 		 286 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 164 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  29.63 
 
 		 384 aa  97.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 164 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 154 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  38.18 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  38.18 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  45.13 
 
 		 364 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  38.18 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  38.18 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  38.18 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  38.18 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  38.18 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  37.04 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 450 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  36.69 
 
 		 168 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  37.04 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  46.72 
 
 		 577 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  37.96 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  39.71 
 
 		 1048 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  44.04 
 
 		 246 aa  95.1  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>