More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1576 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1267 aa  2590  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.15 
 
 
2213 aa  545  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  7.26448e-07 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
1765 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 
1326 aa  528  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.45 
 
 
1245 aa  529  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  42.29 
 
 
1763 aa  523  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
1582 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  2.34203e-05 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 
1165 aa  508  1e-142  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
1548 aa  506  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
1622 aa  502  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  42.02 
 
 
1765 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  41.6 
 
 
2035 aa  490  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
1768 aa  493  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 
1767 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
2654 aa  486  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 
1230 aa  485  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1767 aa  486  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
1767 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  43.02 
 
 
1030 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 
1771 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  40.54 
 
 
1331 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
1786 aa  471  1e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  38.05 
 
 
1439 aa  472  1e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
1784 aa  471  1e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.88 
 
 
1234 aa  470  1e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 
1782 aa  472  1e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 
1611 aa  471  1e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 
1245 aa  466  1e-130  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 
1340 aa  469  1e-130  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.36 
 
 
1245 aa  467  1e-130  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 
1238 aa  467  1e-130  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
1166 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.97 
 
 
1234 aa  465  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 
1792 aa  466  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
1284 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  40.5 
 
 
1200 aa  465  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 
1238 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 
1238 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 
1238 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
1128 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  41.16 
 
 
1236 aa  462  1e-128  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 
1236 aa  462  1e-128  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 
1236 aa  462  1e-128  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 
1236 aa  462  1e-128  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  39.97 
 
 
1683 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  40.41 
 
 
1188 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
920 aa  454  1e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
1236 aa  449  1e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  40.86 
 
 
1233 aa  445  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
816 aa  442  1e-122  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
957 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.17317e-06 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
1303 aa  439  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 
1193 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  40.34 
 
 
1574 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
1266 aa  436  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
1005 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 
1033 aa  432  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
1625 aa  433  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 
812 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
1303 aa  428  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  35.98 
 
 
1626 aa  429  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  36.34 
 
 
1417 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
1310 aa  426  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 
1363 aa  422  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 
981 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 
1659 aa  422  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.46 
 
 
1788 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 
1629 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 
1629 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
1202 aa  418  1e-115  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 
1560 aa  415  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
1009 aa  416  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
912 aa  415  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
1118 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.37 
 
 
1369 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 
1333 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.02305e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
1240 aa  407  1e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 
1398 aa  408  1e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  41.09 
 
 
1135 aa  409  1e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  35.73 
 
 
1418 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 
1069 aa  405  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.13 
 
 
1040 aa  406  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
929 aa  402  1e-110  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.68 
 
 
1053 aa  402  1e-110  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.54 
 
 
916 aa  402  1e-110  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
1397 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
778 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
833 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
1021 aa  396  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
1426 aa  396  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  34 
 
 
1287 aa  396  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  40.4 
 
 
1346 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
1632 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 
1333 aa  392  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
1203 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
1240 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 
1603 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  42 
 
 
1442 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
1255 aa  385  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
1550 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>