More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2453 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  64.1 
 
 		 234 aa  321  6e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  61.04 
 
 		 233 aa  304  7e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  62.61 
 
 		 233 aa  299  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  62.61 
 
 		 233 aa  299  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  60.17 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  60.43 
 
 		 233 aa  295  3e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  59.13 
 
 		 233 aa  293  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  63.04 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  57.58 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  58.97 
 
 		 234 aa  286  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  58.87 
 
 		 233 aa  285  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  57.58 
 
 		 236 aa  282  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  57.14 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  55.36 
 
 		 239 aa  278  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  59.57 
 
 		 233 aa  277  9e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  53.91 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  56.09 
 
 		 233 aa  271  7e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  53.22 
 
 		 236 aa  271  7e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  53.68 
 
 		 236 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  52.38 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  51.29 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  50.86 
 
 		 244 aa  254  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  51.52 
 
 		 232 aa  254  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  52.02 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  53.33 
 
 		 244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  54.67 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  51.52 
 
 		 245 aa  249  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  52.47 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  52.16 
 
 		 236 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  52.47 
 
 		 244 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  51.12 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  50.64 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  52.73 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  52.02 
 
 		 248 aa  245  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  50.42 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  48.93 
 
 		 235 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  49.36 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  51.07 
 
 		 244 aa  242  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  50.64 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  47.21 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 		 235 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  49.78 
 
 		 234 aa  237  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  49.78 
 
 		 234 aa  237  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  48.5 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  48.71 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  48.93 
 
 		 240 aa  234  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  47.84 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  46.55 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  45.45 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  47.39 
 
 		 245 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  48.9 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  50.22 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  43.88 
 
 		 604 aa  226  3e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.78 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.78 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  47.19 
 
 		 238 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  47.23 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  47.84 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 345 aa  223  3e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  51.87 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  48.71 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  46.08 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  44.39 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  44.69 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  44.69 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  43.36 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  44.87 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 248 aa  203  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  44.39 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  45.41 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  43.78 
 
 		 225 aa  201  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  44.98 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 286 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.54 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  42.36 
 
 		 293 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  46.41 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  43.48 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  39.46 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  46.6 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  40.44 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  42.73 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 648 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  44.34 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40.53 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  41.03 
 
 		 300 aa  195  6e-49  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.62 
 
 		 648 aa  195  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.62 
 
 		 648 aa  195  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  42.62 
 
 		 648 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  42.62 
 
 		 648 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.62 
 
 		 648 aa  195  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.62 
 
 		 648 aa  195  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  42.15 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>