More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1167 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
239 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.54 
 
 
232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.81 
 
 
236 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
236 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
236 aa  188  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
236 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
236 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
236 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.64 
 
 
226 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
225 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.75 
 
 
231 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  33.33 
 
 
230 aa  129  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.95 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  32.54 
 
 
225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  33 
 
 
231 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
227 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.41 
 
 
234 aa  125  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.06 
 
 
226 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.9 
 
 
226 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 
227 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.01 
 
 
225 aa  123  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.06 
 
 
238 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
249 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
261 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.67 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.84 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.29 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  30.66 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  28.85 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.67 
 
 
227 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
225 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.73 
 
 
225 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.55 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.86 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.5 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.67 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.52 
 
 
224 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 
227 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.96 
 
 
229 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.5 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
234 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.44 
 
 
222 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  29.25 
 
 
221 aa  112  7.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.08 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  28.5 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.59 
 
 
236 aa  109  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 
227 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
229 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
228 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27 
 
 
231 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.02 
 
 
236 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
221 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  29.05 
 
 
224 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.05 
 
 
225 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  29.05 
 
 
224 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.1 
 
 
224 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
231 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.86 
 
 
229 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
238 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 
225 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  33.85 
 
 
355 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
231 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
226 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
230 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 
229 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.88 
 
 
220 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
231 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
229 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  26.89 
 
 
222 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.06 
 
 
254 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
224 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.7 
 
 
229 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
238 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
246 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1850  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
211 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.89 
 
 
223 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
233 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  31.58 
 
 
352 aa  102  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  31.86 
 
 
214 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
240 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1838  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.59 
 
 
225 aa  101  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0983527  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
251 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
251 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
251 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>