119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0072 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 
384 aa  800    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  36.79 
 
 
349 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  39.1 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  37.42 
 
 
307 aa  205  9e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  33.42 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  31.31 
 
 
503 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 
312 aa  182  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  32.27 
 
 
316 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  32.47 
 
 
420 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  32.23 
 
 
358 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  32.39 
 
 
451 aa  159  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.22 
 
 
433 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  33.44 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  31.13 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  32.48 
 
 
426 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  31.91 
 
 
427 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  28.96 
 
 
430 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 
793 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.42 
 
 
1115 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.74 
 
 
1115 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.24 
 
 
1119 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.4 
 
 
1115 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25.5 
 
 
1115 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  27.96 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  25.87 
 
 
343 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  29.14 
 
 
647 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  26.67 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 
1124 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  25.75 
 
 
428 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.37 
 
 
470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.18 
 
 
927 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  28.9 
 
 
542 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  27.3 
 
 
423 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 
356 aa  126  7e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  24.53 
 
 
356 aa  125  9e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 
430 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  26.3 
 
 
426 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  27.39 
 
 
430 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  27.39 
 
 
430 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  27.39 
 
 
430 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  27.39 
 
 
430 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  27.39 
 
 
430 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  27.33 
 
 
430 aa  123  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  27.07 
 
 
430 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  27.07 
 
 
430 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  24.65 
 
 
428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 
1154 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  27.24 
 
 
579 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 
1118 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  26.67 
 
 
444 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  29.04 
 
 
688 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 
567 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 
1101 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 
329 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  23.42 
 
 
583 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  25.96 
 
 
580 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  22.12 
 
 
521 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  22.17 
 
 
1002 aa  73.9  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  23.27 
 
 
426 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  27.2 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.95 
 
 
872 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  24.5 
 
 
418 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  25 
 
 
1271 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  22.78 
 
 
418 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  25 
 
 
342 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  24.51 
 
 
1782 aa  63.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  24.69 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2820  hypothetical protein  28.06 
 
 
822 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  25.54 
 
 
587 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  21.93 
 
 
1120 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2210  hypothetical protein  21.14 
 
 
357 aa  60.1  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.179103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1613  glycosyl hydrolase-like protein  25.9 
 
 
807 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.5027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3919  chitinase II  24.22 
 
 
695 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00105192  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  25.66 
 
 
414 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  24.83 
 
 
372 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  24.47 
 
 
484 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1268  glycosyl hydrolase-like protein  27.34 
 
 
808 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4560  glycoside hydrolase family protein  22.38 
 
 
340 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  26.4 
 
 
540 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  23.72 
 
 
674 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  23.4 
 
 
674 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  23.4 
 
 
674 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  23.4 
 
 
674 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  26.29 
 
 
1115 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  23.4 
 
 
674 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  23.4 
 
 
674 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 
426 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  23.72 
 
 
674 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  23.4 
 
 
674 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10502  conserved hypothetical protein  31.06 
 
 
678 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  27.05 
 
 
536 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  27.12 
 
 
536 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 
674 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  26.1 
 
 
1132 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  23.56 
 
 
541 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1379  glycosyl hydrolase-like protein  23.51 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  23.08 
 
 
674 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  23.08 
 
 
674 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  23.9 
 
 
1598 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>