211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1529 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  100 
 
 
585 aa  1204    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  33.15 
 
 
569 aa  297  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  34.66 
 
 
562 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  35.14 
 
 
565 aa  296  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  33.93 
 
 
570 aa  294  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.64 
 
 
557 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  34.41 
 
 
562 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  34.41 
 
 
562 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.46 
 
 
573 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.78 
 
 
549 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.78 
 
 
568 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.58 
 
 
554 aa  256  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.38 
 
 
554 aa  253  9.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.48 
 
 
560 aa  249  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.86 
 
 
558 aa  243  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.42 
 
 
591 aa  239  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.85 
 
 
592 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.04 
 
 
591 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.04 
 
 
591 aa  234  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.73 
 
 
565 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  29.95 
 
 
582 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  31.5 
 
 
575 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.08 
 
 
563 aa  206  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  32.18 
 
 
558 aa  206  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  31.53 
 
 
602 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  29.85 
 
 
585 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  29.85 
 
 
568 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.71 
 
 
608 aa  203  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  29.66 
 
 
585 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.46 
 
 
580 aa  201  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.89 
 
 
582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  33.87 
 
 
570 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  28.06 
 
 
578 aa  196  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.53 
 
 
592 aa  196  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.48 
 
 
562 aa  196  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  26.48 
 
 
562 aa  196  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  27.32 
 
 
581 aa  194  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  27.39 
 
 
586 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.68 
 
 
575 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.53 
 
 
586 aa  193  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  28.72 
 
 
586 aa  193  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  28.32 
 
 
583 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.1 
 
 
581 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.25 
 
 
584 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  29.37 
 
 
561 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.71 
 
 
593 aa  191  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  30.24 
 
 
562 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.52 
 
 
595 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  27.42 
 
 
578 aa  189  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  28.35 
 
 
590 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.35 
 
 
594 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  28.51 
 
 
590 aa  187  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.94 
 
 
574 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  28.02 
 
 
583 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  27.72 
 
 
562 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.89 
 
 
562 aa  181  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  27.89 
 
 
562 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  30.38 
 
 
565 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.69 
 
 
560 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  28.91 
 
 
588 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  27.19 
 
 
570 aa  177  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  27.18 
 
 
584 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.35 
 
 
563 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  29.04 
 
 
564 aa  171  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  28.23 
 
 
584 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.34 
 
 
610 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.12 
 
 
568 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  29.12 
 
 
572 aa  161  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.99 
 
 
585 aa  157  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.56 
 
 
513 aa  156  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  25.5 
 
 
550 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.1 
 
 
597 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.16 
 
 
580 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  26.14 
 
 
566 aa  154  5e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.7 
 
 
559 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.51 
 
 
581 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.42 
 
 
553 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  25.42 
 
 
553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  25.83 
 
 
574 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.4 
 
 
593 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  25.56 
 
 
539 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.72 
 
 
570 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  24.36 
 
 
590 aa  139  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  24.16 
 
 
590 aa  139  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.65 
 
 
566 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  25.35 
 
 
554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  25 
 
 
558 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  26.42 
 
 
554 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  25 
 
 
558 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  25 
 
 
551 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  25 
 
 
554 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  25.42 
 
 
520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  24.06 
 
 
547 aa  126  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.89 
 
 
587 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.4 
 
 
556 aa  124  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.65 
 
 
567 aa  107  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.33 
 
 
583 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  22.13 
 
 
588 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  25.43 
 
 
607 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.92 
 
 
585 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>