70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0431 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  304  4.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  37.74 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  39.33 
 
 		 169 aa  90.5  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  39.71 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  34.81 
 
 		 270 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  34.04 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  35.42 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  37.24 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  33.99 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  32.28 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  38 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  34.04 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  36.55 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  32.86 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  31.47 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  25 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  29.73 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  32.41 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  28.82 
 
 		 202 aa  57.4  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 		 415 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  25.49 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  29.79 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  32.43 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  31.76 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  31.88 
 
 		 634 aa  53.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  29.73 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  31.1 
 
 		 424 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  28.38 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1779  RDD protein  24.83 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2282  RDD domain containing protein  28.87 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  31.13 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  36.36 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  29.05 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0008  hypothetical protein  27.1 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018988  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 258 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2108  RDD protein  25.17 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  28.08 
 
 		 254 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1846  RDD family protein  24.83 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  34.44 
 
 		 590 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0257  hypothetical protein  26.15 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0230  hypothetical protein  24.62 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0283  hypothetical protein  25.38 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  32.32 
 
 		 278 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 274 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3395  RDD domain-containing protein  23.76 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  30.86 
 
 		 261 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  26.95 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  30.22 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  30.3 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3357  RDD family membrane protein  34.07 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0260303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  36.05 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  36.76 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1510  conserved hypothetical protein (RDD domain protein)  23.02 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  31.58 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  31.58 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  31.58 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06647  hypothetical protein  29.55 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  36.71 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  24.38 
 
 		 247 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0451  RDD domain-containing protein  26.9 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  38.24 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2719  RDD domain-containing protein  24.81 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000151483  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  27.74 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  32.35 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  31.54 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  34.21 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  28.29 
 
 		 211 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  30.56 
 
 		 231 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  31.51 
 
 		 357 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>