More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0904 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0904  porin  100 
 
 		 360 aa  715    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.3308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4315  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  55.4 
 
 		 357 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2544  porin  45.81 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4558  porin  46.43 
 
 		 360 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0301  porin  44.41 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419349  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3812  porin  45.24 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.625248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  32.93 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  33.63 
 
 		 355 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  34.64 
 
 		 354 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  31.25 
 
 		 355 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  31.25 
 
 		 355 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  33.96 
 
 		 368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  32.92 
 
 		 374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  33.24 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  32.02 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0933  porin  31.5 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  30.73 
 
 		 389 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  29.63 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  31.74 
 
 		 379 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  30.49 
 
 		 392 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  30.49 
 
 		 392 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  33.42 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5778  porin  32.48 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  33.42 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  32.29 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  33.42 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  33.42 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  32.29 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  33.42 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  32.29 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  32.29 
 
 		 449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  32.29 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  33.42 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  32.1 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  33.42 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  32.29 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  30.53 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  32.79 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  30.15 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  32.94 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  30.92 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  33.81 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  29.77 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  30.35 
 
 		 358 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  32.57 
 
 		 368 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  30.26 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  30.75 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5649  outer membrane protein (porin)  33.63 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5210  outer membrane protein (porin)  33.63 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00719172  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  31.99 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  31.99 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  31.99 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  31.76 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  32.72 
 
 		 360 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  31.25 
 
 		 392 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  31.48 
 
 		 384 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  32.05 
 
 		 352 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  30.58 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  31.22 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  30.62 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  32.55 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  32.55 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  31.76 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  32.55 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  30.59 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  30.72 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  31.94 
 
 		 377 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  30.14 
 
 		 386 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  30.39 
 
 		 383 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  31.75 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  29.39 
 
 		 401 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6483  porin  31.32 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6718  porin  31.32 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.457172 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  29.78 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  30.36 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.51 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3269  porin  33.33 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00595502  normal  0.572597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  29.41 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  29.41 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3000  porin Gram-negative type  30.13 
 
 		 348 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  32.5 
 
 		 347 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  30.45 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  31.54 
 
 		 391 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  28.9 
 
 		 413 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  31.9 
 
 		 353 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3860  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.69 
 
 		 384 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.087708  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  29.38 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3347  porin Gram-negative type  29.87 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  29.63 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  31.15 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  31.2 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  31.48 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  30.53 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  29.19 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  31.48 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  30.72 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  29.46 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  28.77 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  30.93 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  30.93 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>