187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0099 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
287 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  27.65 
 
 
271 aa  115  7e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  5.41539e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  27.57 
 
 
272 aa  110  2e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 
244 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  28.08 
 
 
256 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
279 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  27.49 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.73 
 
 
255 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 
257 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 
269 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  26.12 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 
257 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 
327 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 
271 aa  85.9  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  25.94 
 
 
257 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  26.88 
 
 
256 aa  84.3  2e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 
259 aa  84.3  2e-15  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  23.97 
 
 
309 aa  84.7  2e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
261 aa  84.3  2e-15  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  30.29 
 
 
275 aa  82  1e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 
271 aa  82  1e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  9.08006e-06 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 
273 aa  81.3  2e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  25.59 
 
 
253 aa  80.1  4e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  28.14 
 
 
269 aa  80.1  4e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.83 
 
 
260 aa  79.7  5e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  24.21 
 
 
289 aa  79.3  6e-14  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 
253 aa  79  9e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 
277 aa  78.6  1e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  29.53 
 
 
281 aa  77.8  2e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 
281 aa  77.4  3e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  25.37 
 
 
287 aa  76.6  5e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 
286 aa  75.9  7e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 
278 aa  75.1  1e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  22.99 
 
 
278 aa  75.1  1e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 
275 aa  74.7  2e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  25 
 
 
252 aa  72.8  5e-12  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 
282 aa  73.2  5e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 
278 aa  72  1e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  22.93 
 
 
279 aa  71.2  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  23.92 
 
 
305 aa  70.9  3e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 
281 aa  70.1  4e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 
272 aa  70.1  4e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 
254 aa  68.9  9e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.17 
 
 
289 aa  68.9  9e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  24.12 
 
 
274 aa  67  3e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  23.64 
 
 
271 aa  67  3e-10  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.82 
 
 
288 aa  65.9  7e-10  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  23.72 
 
 
274 aa  65.9  7e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 
268 aa  65.9  8e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  22.28 
 
 
276 aa  65.1  1e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  24.32 
 
 
257 aa  65.5  1e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  22.52 
 
 
265 aa  64.7  2e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  22.78 
 
 
297 aa  63.9  3e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  26.74 
 
 
277 aa  63.5  3e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  26.82 
 
 
278 aa  63.9  3e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  24.71 
 
 
271 aa  63.5  4e-09  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  31 
 
 
277 aa  62.8  6e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1930  AraC family transcriptional regulator  24.3 
 
 
296 aa  62.4  9e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 
271 aa  62  1e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  24.14 
 
 
266 aa  61.6  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  22.12 
 
 
274 aa  60.8  2e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
294 aa  60.8  2e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 
297 aa  61.2  2e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 
253 aa  60.5  3e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  23.77 
 
 
246 aa  60.5  3e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  22.31 
 
 
251 aa  60.1  4e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  22.96 
 
 
273 aa  60.1  4e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 
271 aa  58.9  9e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  21.89 
 
 
267 aa  58.9  1e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.29 
 
 
284 aa  58.5  1e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0687  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 
293 aa  58.5  1e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.50177  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0497  helix-turn-helix domain-containing protein  23.9 
 
 
263 aa  58.2  1e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516029  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 
252 aa  58.5  1e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  23.63 
 
 
298 aa  57.8  2e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 
292 aa  57.8  2e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
310 aa  57  4e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  25.14 
 
 
246 aa  57  4e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  23.98 
 
 
263 aa  57  4e-07  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
267 aa  56.2  5e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2103  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 
253 aa  56.6  5e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1632  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
291 aa  55.8  8e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0196517  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  28.91 
 
 
274 aa  55.5  9e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
272 aa  55.1  1e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 
299 aa  55.5  1e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3635  helix-turn-helix domain-containing protein  20.53 
 
 
249 aa  55.1  1e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  25.39 
 
 
277 aa  54.7  2e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2336  hypothetical protein  31.96 
 
 
274 aa  53.9  3e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.429257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 
229 aa  53.9  3e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  23.44 
 
 
291 aa  53.1  5e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  21.68 
 
 
279 aa  53.1  5e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 
309 aa  52.8  6e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1655  hypothetical protein  23.17 
 
 
271 aa  52.8  6e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  21.67 
 
 
239 aa  52.8  6e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  20.34 
 
 
273 aa  52.8  7e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  22.08 
 
 
282 aa  52.8  7e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  24.49 
 
 
285 aa  51.6  1e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>