187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0099 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 287 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  27.57 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  28.08 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  27.49 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.73 
 
 		 255 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  26.12 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 		 257 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 257 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  26.88 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  23.97 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  30.29 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  28.14 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  25.59 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.83 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  29.53 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  25.37 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  22.99 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  25 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  22.93 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  23.92 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.17 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  24.12 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  23.64 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.82 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  23.72 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  24.32 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  22.28 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  22.52 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  26.74 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  24.71 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  31 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1930  AraC family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  22.12 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  24.14 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  23.77 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  22.31 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.29 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0687  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.50177  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0497  helix-turn-helix domain-containing protein  23.9 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  23.63 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  25.14 
 
 		 246 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  23.98 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2103  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1632  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0196517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  28.91 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3635  helix-turn-helix domain-containing protein  20.53 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440298 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 		 229 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2336  hypothetical protein  31.96 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.429257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  23.44 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  21.68 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1655  hypothetical protein  23.17 
 
 		 271 aa  52.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 309 aa  52.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  20.34 
 
 		 273 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  22.08 
 
 		 282 aa  52.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.14 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>