164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0190 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  100 
 
 
600 aa  1226    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  66.23 
 
 
599 aa  774    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1270  proteinase inhibitor I4, serpin  45.7 
 
 
407 aa  326  6e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4673  proteinase inhibitor I4, serpin  33.6 
 
 
442 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1826  proteinase inhibitor I4 serpin  31.51 
 
 
429 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5492  proteinase inhibitor I4 serpin  33.25 
 
 
412 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0717  proteinase inhibitor I4 serpin  36.13 
 
 
344 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3664  proteinase inhibitor I4 serpin  30.89 
 
 
393 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000611226  normal  0.325376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0296  proteinase inhibitor I4 serpin  31.88 
 
 
423 aa  193  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2010  proteinase inhibitor I4 serpin  27.79 
 
 
432 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1900  proteinase inhibitor I4 serpin  32.69 
 
 
413 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274558  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0460  proteinase inhibitor I4, serpin  31.88 
 
 
434 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0999563  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1669  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 
400 aa  180  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0702  proteinase inhibitor I4, serpin  33.42 
 
 
420 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0529  proteinase inhibitor I4, serpin  30.1 
 
 
422 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1230  proteinase inhibitor I4, serpin  29.21 
 
 
415 aa  161  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0395  proteinase inhibitor I4 serpin  29.02 
 
 
475 aa  160  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1742  proteinase inhibitor I4, serpin  30.55 
 
 
450 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2013  proteinase inhibitor I4 serpin  31.27 
 
 
420 aa  157  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1417  proteinase inhibitor I4 serpin  29.89 
 
 
401 aa  156  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000100118  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0883  proteinase inhibitor I4 serpin  30.6 
 
 
448 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15772  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2014  proteinase inhibitor I4 serpin  30.79 
 
 
420 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0222  serine protease inhibitor family protein  30.51 
 
 
426 aa  148  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_198  serine protease inhibitor protein  30.48 
 
 
426 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1725  proteinase inhibitor I4 serpin  28.28 
 
 
431 aa  146  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1363  proteinase inhibitor I4 serpin  29.2 
 
 
424 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525887  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0107  proteinase inhibitor I4 serpin  30.93 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0732636  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2110  proteinase inhibitor I4 serpin  26.39 
 
 
500 aa  140  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1296  proteinase inhibitor I4 serpin  26.74 
 
 
427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00386806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0132  proteinase inhibitor I4, serpin  30.39 
 
 
426 aa  130  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7222  serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  26.02 
 
 
415 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4176  proteinase inhibitor I4 serpin  28.46 
 
 
430 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0104  proteinase inhibitor I4 serpin  26.91 
 
 
424 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414663  normal  0.0601662 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0130  proteinase inhibitor I4 serpin  27.69 
 
 
445 aa  118  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0455  proteinase inhibitor I4, serpin  29.29 
 
 
385 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4299  proteinase inhibitor I4 serpin  27.58 
 
 
429 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0655436  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0592  proteinase inhibitor I4, serpin  26.19 
 
 
431 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2877  proteinase inhibitor I4 serpin  24.15 
 
 
367 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  54.95 
 
 
591 aa  97.8  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0126  serine proteinase inhibitor  25.63 
 
 
465 aa  96.7  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1921  proteinase inhibitor I4 serpin  25.07 
 
 
393 aa  95.5  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.705743 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0744  proteinase inhibitor I4, serpin  25.07 
 
 
380 aa  94.4  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0682  proteinase inhibitor I4, serpin  23.95 
 
 
560 aa  92.8  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7212  proteinase inhibitor I4 serpin  25.71 
 
 
394 aa  90.9  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.743883  normal  0.0513448 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  60 
 
 
411 aa  90.9  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  56.76 
 
 
707 aa  90.1  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  65.15 
 
 
630 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1933  proteinase inhibitor I4, serpin  22.98 
 
 
366 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1270  proteinase inhibitor I4 serpin  21.28 
 
 
351 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  56.16 
 
 
582 aa  88.2  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  58.82 
 
 
789 aa  87  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  62.32 
 
 
710 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  55.13 
 
 
537 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.88 
 
 
831 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13780  serine protease inhibitor  22.6 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.216143  normal  0.0648597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  38.93 
 
 
554 aa  84  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  56.94 
 
 
484 aa  83.6  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  56.52 
 
 
477 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  61.19 
 
 
928 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  49.41 
 
 
814 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  46.32 
 
 
710 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  52.05 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1947  proteinase inhibitor I4 serpin  21.91 
 
 
426 aa  80.1  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0171189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  42.31 
 
 
649 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  55.07 
 
 
842 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  55.88 
 
 
611 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  55.56 
 
 
820 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04150  serine protease inhibitor  24.45 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.393298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  42.24 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.35 
 
 
1051 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  47.5 
 
 
563 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0038  proteinase inhibitor I4 serpin  22.07 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  43.82 
 
 
590 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  38.33 
 
 
1601 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  49.23 
 
 
566 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  52.17 
 
 
567 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.83 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0925  proteinase inhibitor I4 serpin  21 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  54.05 
 
 
1077 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0801  proteinase inhibitor I4, serpin  22.2 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  46.15 
 
 
922 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  38.79 
 
 
741 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  56.25 
 
 
982 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  54.55 
 
 
571 aa  73.9  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  51.52 
 
 
895 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  46.48 
 
 
736 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  57.14 
 
 
773 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  34.26 
 
 
739 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  49.28 
 
 
558 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  45.12 
 
 
790 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
580 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 
639 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  49.23 
 
 
730 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  50.77 
 
 
1224 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
742 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  53.42 
 
 
563 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  57.81 
 
 
837 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
660 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  51.56 
 
 
679 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  54.55 
 
 
683 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>