45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0925 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0925  proteinase inhibitor I4 serpin  100 
 
 
421 aa  805    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0592  proteinase inhibitor I4, serpin  34.92 
 
 
431 aa  187  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0038  proteinase inhibitor I4 serpin  31.72 
 
 
403 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7222  serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  30.13 
 
 
415 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4673  proteinase inhibitor I4, serpin  25.78 
 
 
442 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_198  serine protease inhibitor protein  26.59 
 
 
426 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0222  serine protease inhibitor family protein  26.36 
 
 
426 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1947  proteinase inhibitor I4 serpin  28.72 
 
 
426 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0171189 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0132  proteinase inhibitor I4, serpin  25.45 
 
 
426 aa  96.7  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1363  proteinase inhibitor I4 serpin  26.3 
 
 
424 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525887  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4176  proteinase inhibitor I4 serpin  32.59 
 
 
430 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  21.86 
 
 
600 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0395  proteinase inhibitor I4 serpin  28.57 
 
 
475 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  21.9 
 
 
599 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2014  proteinase inhibitor I4 serpin  22.73 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2110  proteinase inhibitor I4 serpin  26.59 
 
 
500 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0107  proteinase inhibitor I4 serpin  23.48 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0732636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0104  proteinase inhibitor I4 serpin  27.39 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414663  normal  0.0601662 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4299  proteinase inhibitor I4 serpin  24.82 
 
 
429 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0655436  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1826  proteinase inhibitor I4 serpin  25.92 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1669  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.78 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3664  proteinase inhibitor I4 serpin  23.29 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000611226  normal  0.325376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5492  proteinase inhibitor I4 serpin  24.08 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1296  proteinase inhibitor I4 serpin  23.9 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00386806  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0529  proteinase inhibitor I4, serpin  22.28 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2013  proteinase inhibitor I4 serpin  22.16 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2010  proteinase inhibitor I4 serpin  23.05 
 
 
432 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0130  proteinase inhibitor I4 serpin  25.56 
 
 
445 aa  69.7  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0717  proteinase inhibitor I4 serpin  23.06 
 
 
344 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0296  proteinase inhibitor I4 serpin  24.36 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1900  proteinase inhibitor I4 serpin  21.88 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274558  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04150  serine protease inhibitor  29.74 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.393298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1270  proteinase inhibitor I4, serpin  20.79 
 
 
407 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0883  proteinase inhibitor I4 serpin  27.08 
 
 
448 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15772  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0702  proteinase inhibitor I4, serpin  22.76 
 
 
420 aa  62.4  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1230  proteinase inhibitor I4, serpin  25.68 
 
 
415 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1742  proteinase inhibitor I4, serpin  24.55 
 
 
450 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1417  proteinase inhibitor I4 serpin  21.7 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000100118  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0460  proteinase inhibitor I4, serpin  26.3 
 
 
434 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0999563  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1725  proteinase inhibitor I4 serpin  24.1 
 
 
431 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1270  proteinase inhibitor I4 serpin  34.06 
 
 
351 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2877  proteinase inhibitor I4 serpin  32.88 
 
 
367 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0126  serine proteinase inhibitor  22.98 
 
 
465 aa  50.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13780  serine protease inhibitor  26.14 
 
 
375 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.216143  normal  0.0648597 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7212  proteinase inhibitor I4 serpin  25.5 
 
 
394 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.743883  normal  0.0513448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>