52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2877 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2877  proteinase inhibitor I4 serpin  100 
 
 
367 aa  710    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1933  proteinase inhibitor I4, serpin  50.55 
 
 
366 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192792  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13780  serine protease inhibitor  39.62 
 
 
375 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.216143  normal  0.0648597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1270  proteinase inhibitor I4 serpin  41.06 
 
 
351 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1826  proteinase inhibitor I4 serpin  32.58 
 
 
429 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0460  proteinase inhibitor I4, serpin  33.16 
 
 
434 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0999563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0104  proteinase inhibitor I4 serpin  33.05 
 
 
424 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414663  normal  0.0601662 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1230  proteinase inhibitor I4, serpin  33.53 
 
 
415 aa  156  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0883  proteinase inhibitor I4 serpin  32.1 
 
 
448 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15772  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1363  proteinase inhibitor I4 serpin  31.38 
 
 
424 aa  149  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0222  serine protease inhibitor family protein  29.09 
 
 
426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_198  serine protease inhibitor protein  28.65 
 
 
426 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0107  proteinase inhibitor I4 serpin  27.22 
 
 
413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0732636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0395  proteinase inhibitor I4 serpin  34.66 
 
 
475 aa  135  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4176  proteinase inhibitor I4 serpin  35.42 
 
 
430 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1725  proteinase inhibitor I4 serpin  27.49 
 
 
431 aa  135  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0529  proteinase inhibitor I4, serpin  26.88 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4673  proteinase inhibitor I4, serpin  28.29 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1296  proteinase inhibitor I4 serpin  26.23 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00386806  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1669  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
400 aa  129  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0132  proteinase inhibitor I4, serpin  28.57 
 
 
426 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2110  proteinase inhibitor I4 serpin  34.93 
 
 
500 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1417  proteinase inhibitor I4 serpin  27.2 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000100118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5492  proteinase inhibitor I4 serpin  28.41 
 
 
412 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3664  proteinase inhibitor I4 serpin  26.67 
 
 
393 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000611226  normal  0.325376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2010  proteinase inhibitor I4 serpin  25 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1270  proteinase inhibitor I4, serpin  24.87 
 
 
407 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0702  proteinase inhibitor I4, serpin  23.9 
 
 
420 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  24.67 
 
 
600 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0717  proteinase inhibitor I4 serpin  28.61 
 
 
344 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1742  proteinase inhibitor I4, serpin  26.05 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1900  proteinase inhibitor I4 serpin  25.85 
 
 
413 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274558  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0592  proteinase inhibitor I4, serpin  27.78 
 
 
431 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0296  proteinase inhibitor I4 serpin  27.78 
 
 
423 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  25.33 
 
 
599 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7222  serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  26.84 
 
 
415 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04150  serine protease inhibitor  28.68 
 
 
418 aa  93.6  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.393298  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0130  proteinase inhibitor I4 serpin  27.73 
 
 
445 aa  90.1  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1947  proteinase inhibitor I4 serpin  30.08 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0171189 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0126  serine proteinase inhibitor  24.86 
 
 
465 aa  88.2  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0744  proteinase inhibitor I4, serpin  30.8 
 
 
380 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0038  proteinase inhibitor I4 serpin  31.51 
 
 
403 aa  84  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2013  proteinase inhibitor I4 serpin  24.12 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1921  proteinase inhibitor I4 serpin  28.9 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.705743 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2014  proteinase inhibitor I4 serpin  23.43 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7212  proteinase inhibitor I4 serpin  28.37 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.743883  normal  0.0513448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4299  proteinase inhibitor I4 serpin  22.56 
 
 
429 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0655436  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6054  proteinase inhibitor I4 serpin  29.27 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0455  proteinase inhibitor I4, serpin  25.76 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0682  proteinase inhibitor I4, serpin  25.74 
 
 
560 aa  56.2  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0689  Serine protease inhibitor-like protein  38.81 
 
 
88 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.165227  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0925  proteinase inhibitor I4 serpin  33.17 
 
 
421 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>