54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1270 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1270  proteinase inhibitor I4, serpin  100 
 
 		 407 aa  828    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  45.7 
 
 		 600 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  42.86 
 
 		 599 aa  308  8e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1826  proteinase inhibitor I4 serpin  38.4 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4673  proteinase inhibitor I4, serpin  36.9 
 
 		 442 aa  256  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1900  proteinase inhibitor I4 serpin  35.78 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3664  proteinase inhibitor I4 serpin  33.25 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000611226  normal  0.325376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5492  proteinase inhibitor I4 serpin  32.11 
 
 		 412 aa  219  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2010  proteinase inhibitor I4 serpin  31.79 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0702  proteinase inhibitor I4, serpin  35.34 
 
 		 420 aa  206  7e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0717  proteinase inhibitor I4 serpin  36.13 
 
 		 344 aa  206  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1230  proteinase inhibitor I4, serpin  32.7 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1417  proteinase inhibitor I4 serpin  36.46 
 
 		 401 aa  193  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000100118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0296  proteinase inhibitor I4 serpin  32.68 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1669  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.21 
 
 		 400 aa  189  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_198  serine protease inhibitor protein  33.57 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0222  serine protease inhibitor family protein  33.57 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1725  proteinase inhibitor I4 serpin  31.87 
 
 		 431 aa  186  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1742  proteinase inhibitor I4, serpin  32.72 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0460  proteinase inhibitor I4, serpin  34.38 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0999563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0132  proteinase inhibitor I4, serpin  33.02 
 
 		 426 aa  179  8e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2013  proteinase inhibitor I4 serpin  31.91 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2014  proteinase inhibitor I4 serpin  31.91 
 
 		 420 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0883  proteinase inhibitor I4 serpin  32.89 
 
 		 448 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0529  proteinase inhibitor I4, serpin  32.53 
 
 		 422 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0104  proteinase inhibitor I4 serpin  31.62 
 
 		 424 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414663  normal  0.0601662 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1363  proteinase inhibitor I4 serpin  31.3 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0395  proteinase inhibitor I4 serpin  30.67 
 
 		 475 aa  162  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0107  proteinase inhibitor I4 serpin  30.62 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0732636  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1296  proteinase inhibitor I4 serpin  31.59 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00386806  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2110  proteinase inhibitor I4 serpin  29.5 
 
 		 500 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4176  proteinase inhibitor I4 serpin  30 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0130  proteinase inhibitor I4 serpin  28.01 
 
 		 445 aa  122  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04150  serine protease inhibitor  27.27 
 
 		 418 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.393298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13780  serine protease inhibitor  24.58 
 
 		 375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.216143  normal  0.0648597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7222  serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  24.09 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2877  proteinase inhibitor I4 serpin  24.61 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4299  proteinase inhibitor I4 serpin  26.26 
 
 		 429 aa  99.8  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0655436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0744  proteinase inhibitor I4, serpin  24.46 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1921  proteinase inhibitor I4 serpin  23.89 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.705743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1933  proteinase inhibitor I4, serpin  24.6 
 
 		 366 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192792  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0682  proteinase inhibitor I4, serpin  24.54 
 
 		 560 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0455  proteinase inhibitor I4, serpin  25.41 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0592  proteinase inhibitor I4, serpin  25.27 
 
 		 431 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1270  proteinase inhibitor I4 serpin  21.83 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7212  proteinase inhibitor I4 serpin  29.8 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.743883  normal  0.0513448 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1947  proteinase inhibitor I4 serpin  21.55 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0171189 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0126  serine proteinase inhibitor  25 
 
 		 465 aa  87.4  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0038  proteinase inhibitor I4 serpin  20.33 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6054  proteinase inhibitor I4 serpin  25.97 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0689  Serine protease inhibitor-like protein  42.05 
 
 		 88 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.165227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0801  proteinase inhibitor I4, serpin  23.13 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0925  proteinase inhibitor I4 serpin  20.6 
 
 		 421 aa  53.1  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3278  putative secreted serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  39.66 
 
 		 135 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>