53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0460 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0460  proteinase inhibitor I4, serpin  100 
 
 
434 aa  885    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0999563  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1230  proteinase inhibitor I4, serpin  68.3 
 
 
415 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0883  proteinase inhibitor I4 serpin  53.23 
 
 
448 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15772  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0222  serine protease inhibitor family protein  40.05 
 
 
426 aa  288  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1725  proteinase inhibitor I4 serpin  42.61 
 
 
431 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1669  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.71 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_198  serine protease inhibitor protein  39.9 
 
 
426 aa  283  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0132  proteinase inhibitor I4, serpin  39.41 
 
 
426 aa  279  6e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1417  proteinase inhibitor I4 serpin  40.31 
 
 
401 aa  276  7e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000100118  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1363  proteinase inhibitor I4 serpin  38.13 
 
 
424 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525887  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1742  proteinase inhibitor I4, serpin  36.28 
 
 
450 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0529  proteinase inhibitor I4, serpin  34.25 
 
 
422 aa  250  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0702  proteinase inhibitor I4, serpin  34.87 
 
 
420 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4176  proteinase inhibitor I4 serpin  38.85 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0107  proteinase inhibitor I4 serpin  37.62 
 
 
413 aa  244  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0732636  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2110  proteinase inhibitor I4 serpin  39.48 
 
 
500 aa  235  9e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1296  proteinase inhibitor I4 serpin  35.4 
 
 
427 aa  227  4e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00386806  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0395  proteinase inhibitor I4 serpin  35.5 
 
 
475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4673  proteinase inhibitor I4, serpin  34.57 
 
 
442 aa  213  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1826  proteinase inhibitor I4 serpin  33.16 
 
 
429 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0104  proteinase inhibitor I4 serpin  33.07 
 
 
424 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414663  normal  0.0601662 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1270  proteinase inhibitor I4, serpin  34.38 
 
 
407 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  31.44 
 
 
600 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5492  proteinase inhibitor I4 serpin  32.84 
 
 
412 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0717  proteinase inhibitor I4 serpin  34.25 
 
 
344 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  29.93 
 
 
599 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3664  proteinase inhibitor I4 serpin  30.1 
 
 
393 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000611226  normal  0.325376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2010  proteinase inhibitor I4 serpin  30.53 
 
 
432 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1900  proteinase inhibitor I4 serpin  30.33 
 
 
413 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274558  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2877  proteinase inhibitor I4 serpin  33.16 
 
 
367 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13780  serine protease inhibitor  31.75 
 
 
375 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.216143  normal  0.0648597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0296  proteinase inhibitor I4 serpin  31.48 
 
 
423 aa  153  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7222  serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  31.37 
 
 
415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1270  proteinase inhibitor I4 serpin  31.2 
 
 
351 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0130  proteinase inhibitor I4 serpin  32.05 
 
 
445 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04150  serine protease inhibitor  30.27 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.393298  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0455  proteinase inhibitor I4, serpin  30.09 
 
 
385 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0592  proteinase inhibitor I4, serpin  29.32 
 
 
431 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2014  proteinase inhibitor I4 serpin  25.99 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0744  proteinase inhibitor I4, serpin  30.75 
 
 
380 aa  117  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1921  proteinase inhibitor I4 serpin  31.19 
 
 
393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.705743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1933  proteinase inhibitor I4, serpin  31.68 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2013  proteinase inhibitor I4 serpin  26.09 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0682  proteinase inhibitor I4, serpin  29.6 
 
 
560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0126  serine proteinase inhibitor  28.46 
 
 
465 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1947  proteinase inhibitor I4 serpin  28.91 
 
 
426 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0171189 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4299  proteinase inhibitor I4 serpin  27.03 
 
 
429 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0655436  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0038  proteinase inhibitor I4 serpin  27.39 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7212  proteinase inhibitor I4 serpin  28.24 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.743883  normal  0.0513448 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0689  Serine protease inhibitor-like protein  44.32 
 
 
88 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.165227  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3278  putative secreted serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  39.64 
 
 
135 aa  60.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6054  proteinase inhibitor I4 serpin  28.46 
 
 
394 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0925  proteinase inhibitor I4 serpin  25.78 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>