53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_198 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0222  serine protease inhibitor family protein  98.12 
 
 
426 aa  856    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0132  proteinase inhibitor I4, serpin  85.92 
 
 
426 aa  738    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_198  serine protease inhibitor protein  100 
 
 
426 aa  870    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4176  proteinase inhibitor I4 serpin  40.38 
 
 
430 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0460  proteinase inhibitor I4, serpin  39.9 
 
 
434 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0999563  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1417  proteinase inhibitor I4 serpin  41.45 
 
 
401 aa  282  9e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000100118  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1669  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.04 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2110  proteinase inhibitor I4 serpin  40.05 
 
 
500 aa  263  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0883  proteinase inhibitor I4 serpin  40.91 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15772  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1230  proteinase inhibitor I4, serpin  37.28 
 
 
415 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0395  proteinase inhibitor I4 serpin  38.2 
 
 
475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1363  proteinase inhibitor I4 serpin  38.68 
 
 
424 aa  227  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525887  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1725  proteinase inhibitor I4 serpin  34.02 
 
 
431 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0104  proteinase inhibitor I4 serpin  34.54 
 
 
424 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414663  normal  0.0601662 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0702  proteinase inhibitor I4, serpin  33.95 
 
 
420 aa  203  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1296  proteinase inhibitor I4 serpin  32.27 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00386806  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1742  proteinase inhibitor I4, serpin  32.09 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0107  proteinase inhibitor I4 serpin  31.99 
 
 
413 aa  200  3e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0732636  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0529  proteinase inhibitor I4, serpin  34.73 
 
 
422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0296  proteinase inhibitor I4 serpin  33.95 
 
 
423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1826  proteinase inhibitor I4 serpin  35 
 
 
429 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1900  proteinase inhibitor I4 serpin  32.09 
 
 
413 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274558  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0717  proteinase inhibitor I4 serpin  35.65 
 
 
344 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4673  proteinase inhibitor I4, serpin  34.81 
 
 
442 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1270  proteinase inhibitor I4, serpin  33.57 
 
 
407 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7222  serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  30.52 
 
 
415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13780  serine protease inhibitor  30.87 
 
 
375 aa  176  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.216143  normal  0.0648597 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2013  proteinase inhibitor I4 serpin  33.02 
 
 
420 aa  169  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5492  proteinase inhibitor I4 serpin  31.09 
 
 
412 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2010  proteinase inhibitor I4 serpin  29.87 
 
 
432 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3664  proteinase inhibitor I4 serpin  29.57 
 
 
393 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000611226  normal  0.325376 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04150  serine protease inhibitor  31.98 
 
 
418 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.393298  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2014  proteinase inhibitor I4 serpin  31.09 
 
 
420 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0592  proteinase inhibitor I4, serpin  31.88 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  30.48 
 
 
600 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  30.5 
 
 
599 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2877  proteinase inhibitor I4 serpin  28.39 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1270  proteinase inhibitor I4 serpin  29.73 
 
 
351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4299  proteinase inhibitor I4 serpin  29.87 
 
 
429 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0655436  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0130  proteinase inhibitor I4 serpin  29.92 
 
 
445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0126  serine proteinase inhibitor  27.37 
 
 
465 aa  119  7e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1947  proteinase inhibitor I4 serpin  27.65 
 
 
426 aa  116  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0171189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1933  proteinase inhibitor I4, serpin  28.49 
 
 
366 aa  113  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192792  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0455  proteinase inhibitor I4, serpin  29.72 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0038  proteinase inhibitor I4 serpin  27.25 
 
 
403 aa  111  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1921  proteinase inhibitor I4 serpin  29.51 
 
 
393 aa  99.8  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.705743 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0682  proteinase inhibitor I4, serpin  26.27 
 
 
560 aa  99  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7212  proteinase inhibitor I4 serpin  31.47 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.743883  normal  0.0513448 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0744  proteinase inhibitor I4, serpin  28.93 
 
 
380 aa  93.6  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0925  proteinase inhibitor I4 serpin  28.32 
 
 
421 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6054  proteinase inhibitor I4 serpin  29.92 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3278  putative secreted serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  37.27 
 
 
135 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0689  Serine protease inhibitor-like protein  39.53 
 
 
88 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.165227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>