53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3664 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3664  proteinase inhibitor I4 serpin  100 
 
 
393 aa  805    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000611226  normal  0.325376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5492  proteinase inhibitor I4 serpin  46.02 
 
 
412 aa  354  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1826  proteinase inhibitor I4 serpin  33.51 
 
 
429 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1270  proteinase inhibitor I4, serpin  33.25 
 
 
407 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1900  proteinase inhibitor I4 serpin  33.06 
 
 
413 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274558  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4673  proteinase inhibitor I4, serpin  32.23 
 
 
442 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0296  proteinase inhibitor I4 serpin  33 
 
 
423 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  30.89 
 
 
600 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  30.81 
 
 
599 aa  189  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0717  proteinase inhibitor I4 serpin  31.4 
 
 
344 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2010  proteinase inhibitor I4 serpin  27.62 
 
 
432 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2014  proteinase inhibitor I4 serpin  29.33 
 
 
420 aa  176  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0222  serine protease inhibitor family protein  29.84 
 
 
426 aa  170  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1230  proteinase inhibitor I4, serpin  31.01 
 
 
415 aa  170  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_198  serine protease inhibitor protein  29.57 
 
 
426 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0104  proteinase inhibitor I4 serpin  29.74 
 
 
424 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414663  normal  0.0601662 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0702  proteinase inhibitor I4, serpin  28.01 
 
 
420 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0132  proteinase inhibitor I4, serpin  31.18 
 
 
426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0460  proteinase inhibitor I4, serpin  30.1 
 
 
434 aa  163  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0999563  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1725  proteinase inhibitor I4 serpin  31.37 
 
 
431 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2013  proteinase inhibitor I4 serpin  28.57 
 
 
420 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1669  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 
400 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0529  proteinase inhibitor I4, serpin  28.76 
 
 
422 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1363  proteinase inhibitor I4 serpin  28.12 
 
 
424 aa  157  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525887  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0107  proteinase inhibitor I4 serpin  31.17 
 
 
413 aa  155  8e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0732636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1417  proteinase inhibitor I4 serpin  29.44 
 
 
401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000100118  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1296  proteinase inhibitor I4 serpin  27.35 
 
 
427 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00386806  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0883  proteinase inhibitor I4 serpin  30.18 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15772  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4176  proteinase inhibitor I4 serpin  30.75 
 
 
430 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0592  proteinase inhibitor I4, serpin  29.32 
 
 
431 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1742  proteinase inhibitor I4, serpin  26.37 
 
 
450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7222  serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  27.37 
 
 
415 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2110  proteinase inhibitor I4 serpin  26.02 
 
 
500 aa  125  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0126  serine proteinase inhibitor  25.78 
 
 
465 aa  123  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0395  proteinase inhibitor I4 serpin  27.61 
 
 
475 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1933  proteinase inhibitor I4, serpin  29.27 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0130  proteinase inhibitor I4 serpin  28.03 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04150  serine protease inhibitor  27.42 
 
 
418 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.393298  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2877  proteinase inhibitor I4 serpin  26.38 
 
 
367 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13780  serine protease inhibitor  26.3 
 
 
375 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.216143  normal  0.0648597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1270  proteinase inhibitor I4 serpin  27.22 
 
 
351 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1947  proteinase inhibitor I4 serpin  28.18 
 
 
426 aa  99.8  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0171189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0038  proteinase inhibitor I4 serpin  25.94 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4299  proteinase inhibitor I4 serpin  29.8 
 
 
429 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0655436  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0744  proteinase inhibitor I4, serpin  24.42 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1921  proteinase inhibitor I4 serpin  23.81 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.705743 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7212  proteinase inhibitor I4 serpin  27.59 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.743883  normal  0.0513448 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0455  proteinase inhibitor I4, serpin  24.4 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0682  proteinase inhibitor I4, serpin  21.8 
 
 
560 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6054  proteinase inhibitor I4 serpin  27.46 
 
 
394 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0801  proteinase inhibitor I4, serpin  22.43 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0925  proteinase inhibitor I4 serpin  22.19 
 
 
421 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0689  Serine protease inhibitor-like protein  35.63 
 
 
88 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.165227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>