53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2013 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2014  proteinase inhibitor I4 serpin  74.52 
 
 
420 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2013  proteinase inhibitor I4 serpin  100 
 
 
420 aa  857    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0296  proteinase inhibitor I4 serpin  37.56 
 
 
423 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1900  proteinase inhibitor I4 serpin  32.68 
 
 
413 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274558  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4673  proteinase inhibitor I4, serpin  32.37 
 
 
442 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0717  proteinase inhibitor I4 serpin  34.68 
 
 
344 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1826  proteinase inhibitor I4 serpin  30.41 
 
 
429 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1270  proteinase inhibitor I4, serpin  31.91 
 
 
407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_198  serine protease inhibitor protein  33.02 
 
 
426 aa  169  8e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0222  serine protease inhibitor family protein  32.17 
 
 
426 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3664  proteinase inhibitor I4 serpin  28.57 
 
 
393 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000611226  normal  0.325376 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  31.27 
 
 
600 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5492  proteinase inhibitor I4 serpin  27.96 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0132  proteinase inhibitor I4, serpin  32.16 
 
 
426 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  29.16 
 
 
599 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1417  proteinase inhibitor I4 serpin  31.32 
 
 
401 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000100118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0104  proteinase inhibitor I4 serpin  28.73 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414663  normal  0.0601662 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1296  proteinase inhibitor I4 serpin  30.15 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00386806  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1363  proteinase inhibitor I4 serpin  28.18 
 
 
424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525887  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0529  proteinase inhibitor I4, serpin  26.26 
 
 
422 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1725  proteinase inhibitor I4 serpin  26.05 
 
 
431 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2110  proteinase inhibitor I4 serpin  27.58 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7222  serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  25 
 
 
415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1669  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.35 
 
 
400 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2010  proteinase inhibitor I4 serpin  27.79 
 
 
432 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0107  proteinase inhibitor I4 serpin  28.22 
 
 
413 aa  123  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0732636  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0130  proteinase inhibitor I4 serpin  26.09 
 
 
445 aa  120  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0460  proteinase inhibitor I4, serpin  26.09 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0999563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0395  proteinase inhibitor I4 serpin  26.25 
 
 
475 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1230  proteinase inhibitor I4, serpin  24.71 
 
 
415 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04150  serine protease inhibitor  24.42 
 
 
418 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.393298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0702  proteinase inhibitor I4, serpin  27.73 
 
 
420 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0038  proteinase inhibitor I4 serpin  25 
 
 
403 aa  106  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4299  proteinase inhibitor I4 serpin  26.94 
 
 
429 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0655436  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0455  proteinase inhibitor I4, serpin  26.22 
 
 
385 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0592  proteinase inhibitor I4, serpin  27.67 
 
 
431 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4176  proteinase inhibitor I4 serpin  26.86 
 
 
430 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0126  serine proteinase inhibitor  25.2 
 
 
465 aa  98.6  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1742  proteinase inhibitor I4, serpin  24.55 
 
 
450 aa  97.1  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0883  proteinase inhibitor I4 serpin  24.62 
 
 
448 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15772  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0682  proteinase inhibitor I4, serpin  22.36 
 
 
560 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1947  proteinase inhibitor I4 serpin  22.25 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0171189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13780  serine protease inhibitor  24.53 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.216143  normal  0.0648597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1270  proteinase inhibitor I4 serpin  23.77 
 
 
351 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1921  proteinase inhibitor I4 serpin  24.8 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.705743 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0744  proteinase inhibitor I4, serpin  24.19 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2877  proteinase inhibitor I4 serpin  23.99 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0925  proteinase inhibitor I4 serpin  22.16 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1933  proteinase inhibitor I4, serpin  26.54 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192792  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7212  proteinase inhibitor I4 serpin  25.2 
 
 
394 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.743883  normal  0.0513448 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6054  proteinase inhibitor I4 serpin  25.79 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0689  Serine protease inhibitor-like protein  37.5 
 
 
88 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.165227  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0801  proteinase inhibitor I4, serpin  22.94 
 
 
408 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>