53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2014 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2014  proteinase inhibitor I4 serpin  100 
 
 
420 aa  855    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2013  proteinase inhibitor I4 serpin  74.52 
 
 
420 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0296  proteinase inhibitor I4 serpin  36.6 
 
 
423 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4673  proteinase inhibitor I4, serpin  33.89 
 
 
442 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1900  proteinase inhibitor I4 serpin  35.07 
 
 
413 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274558  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1826  proteinase inhibitor I4 serpin  30.73 
 
 
429 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0717  proteinase inhibitor I4 serpin  34.88 
 
 
344 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3664  proteinase inhibitor I4 serpin  29.33 
 
 
393 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000611226  normal  0.325376 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1270  proteinase inhibitor I4, serpin  31.91 
 
 
407 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5492  proteinase inhibitor I4 serpin  28.53 
 
 
412 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1417  proteinase inhibitor I4 serpin  32.98 
 
 
401 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000100118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  31.05 
 
 
599 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0222  serine protease inhibitor family protein  30.44 
 
 
426 aa  153  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  30.79 
 
 
600 aa  152  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1363  proteinase inhibitor I4 serpin  29.97 
 
 
424 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_198  serine protease inhibitor protein  31.09 
 
 
426 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0529  proteinase inhibitor I4, serpin  28.21 
 
 
422 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0104  proteinase inhibitor I4 serpin  28.34 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414663  normal  0.0601662 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0132  proteinase inhibitor I4, serpin  30.65 
 
 
426 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1669  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.6 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1296  proteinase inhibitor I4 serpin  29.57 
 
 
427 aa  133  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00386806  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0107  proteinase inhibitor I4 serpin  28.77 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0732636  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1742  proteinase inhibitor I4, serpin  28.06 
 
 
450 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7222  serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  23.63 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0126  serine proteinase inhibitor  27.01 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1725  proteinase inhibitor I4 serpin  23.94 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0702  proteinase inhibitor I4, serpin  27.57 
 
 
420 aa  118  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0460  proteinase inhibitor I4, serpin  27.06 
 
 
434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0999563  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2010  proteinase inhibitor I4 serpin  24.16 
 
 
432 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0395  proteinase inhibitor I4 serpin  26.13 
 
 
475 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0130  proteinase inhibitor I4 serpin  25.63 
 
 
445 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2110  proteinase inhibitor I4 serpin  25.78 
 
 
500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1230  proteinase inhibitor I4, serpin  25.06 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0592  proteinase inhibitor I4, serpin  28.49 
 
 
431 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4299  proteinase inhibitor I4 serpin  26.1 
 
 
429 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0655436  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0455  proteinase inhibitor I4, serpin  25.88 
 
 
385 aa  103  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13780  serine protease inhibitor  25.54 
 
 
375 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.216143  normal  0.0648597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0038  proteinase inhibitor I4 serpin  24.24 
 
 
403 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04150  serine protease inhibitor  23.16 
 
 
418 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.393298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0883  proteinase inhibitor I4 serpin  25.65 
 
 
448 aa  97.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15772  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4176  proteinase inhibitor I4 serpin  26.26 
 
 
430 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0682  proteinase inhibitor I4, serpin  23.45 
 
 
560 aa  94.4  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1947  proteinase inhibitor I4 serpin  23.66 
 
 
426 aa  90.1  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0171189 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1921  proteinase inhibitor I4 serpin  25.79 
 
 
393 aa  89.7  9e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.705743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1270  proteinase inhibitor I4 serpin  24.64 
 
 
351 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0744  proteinase inhibitor I4, serpin  25.87 
 
 
380 aa  84  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0925  proteinase inhibitor I4 serpin  22.22 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2877  proteinase inhibitor I4 serpin  23.16 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1933  proteinase inhibitor I4, serpin  23.87 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192792  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7212  proteinase inhibitor I4 serpin  26.32 
 
 
394 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.743883  normal  0.0513448 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0689  Serine protease inhibitor-like protein  37.08 
 
 
88 aa  56.6  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.165227  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0801  proteinase inhibitor I4, serpin  22.42 
 
 
408 aa  53.5  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6054  proteinase inhibitor I4 serpin  25.69 
 
 
394 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>