47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6054 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_6054  proteinase inhibitor I4 serpin  100 
 
 
394 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7212  proteinase inhibitor I4 serpin  88.75 
 
 
394 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.743883  normal  0.0513448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1826  proteinase inhibitor I4 serpin  27.81 
 
 
429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1900  proteinase inhibitor I4 serpin  29.3 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274558  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4673  proteinase inhibitor I4, serpin  29.23 
 
 
442 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2010  proteinase inhibitor I4 serpin  23.16 
 
 
432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0717  proteinase inhibitor I4 serpin  27.43 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5492  proteinase inhibitor I4 serpin  28.23 
 
 
412 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1725  proteinase inhibitor I4 serpin  26.09 
 
 
431 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0107  proteinase inhibitor I4 serpin  25.79 
 
 
413 aa  97.4  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0732636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3664  proteinase inhibitor I4 serpin  27.75 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000611226  normal  0.325376 
 
 
-
 
NC_002936  DET0222  serine protease inhibitor family protein  27.32 
 
 
426 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1296  proteinase inhibitor I4 serpin  31.33 
 
 
427 aa  94.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00386806  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1417  proteinase inhibitor I4 serpin  26.23 
 
 
401 aa  94.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000100118  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_198  serine protease inhibitor protein  26.6 
 
 
426 aa  92.8  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1669  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.3 
 
 
400 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  24.29 
 
 
600 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0529  proteinase inhibitor I4, serpin  25.06 
 
 
422 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  23 
 
 
599 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0296  proteinase inhibitor I4 serpin  27.6 
 
 
423 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0104  proteinase inhibitor I4 serpin  26.8 
 
 
424 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414663  normal  0.0601662 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1363  proteinase inhibitor I4 serpin  29.24 
 
 
424 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1270  proteinase inhibitor I4, serpin  23.4 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0132  proteinase inhibitor I4, serpin  27.3 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2013  proteinase inhibitor I4 serpin  24.27 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0883  proteinase inhibitor I4 serpin  25.75 
 
 
448 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15772  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2014  proteinase inhibitor I4 serpin  23.81 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0460  proteinase inhibitor I4, serpin  28.46 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0999563  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1230  proteinase inhibitor I4, serpin  26.92 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2877  proteinase inhibitor I4 serpin  27.55 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0395  proteinase inhibitor I4 serpin  26.77 
 
 
475 aa  70.1  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0130  proteinase inhibitor I4 serpin  25.92 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0592  proteinase inhibitor I4, serpin  27.79 
 
 
431 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7222  serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  26.68 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4176  proteinase inhibitor I4 serpin  28.61 
 
 
430 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0126  serine proteinase inhibitor  23.48 
 
 
465 aa  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0702  proteinase inhibitor I4, serpin  24.93 
 
 
420 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13780  serine protease inhibitor  28.37 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.216143  normal  0.0648597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04150  serine protease inhibitor  26.56 
 
 
418 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.393298  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0455  proteinase inhibitor I4, serpin  25.61 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2110  proteinase inhibitor I4 serpin  26.15 
 
 
500 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0038  proteinase inhibitor I4 serpin  25.27 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4299  proteinase inhibitor I4 serpin  25.1 
 
 
429 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0655436  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1933  proteinase inhibitor I4, serpin  25.27 
 
 
366 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192792  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1947  proteinase inhibitor I4 serpin  26.58 
 
 
426 aa  46.2  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0171189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0801  proteinase inhibitor I4, serpin  24.9 
 
 
408 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0744  proteinase inhibitor I4, serpin  23.44 
 
 
380 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>